Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0008200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0374
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31578603-31602881 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31109397-31133675 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-839.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -894.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 644.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Forensic Context

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