Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0009800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0437
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:31581622-31598654 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31112416-31129448 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-654.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -701.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 562.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((.((((((.((....))))))))))))..)))..)(....(((((((((((((..(((((....((((((.((.(((.(((.((..(((((.(((((((....((........)).....))))))).))))).....))..))).))).))))))))((.....)).((((.(((..(.(.((((..((((((((...((..((.....))..))...))))))))...)))).).)..))).))))..((..(((((((((((..((((..........))))........(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))..))..(((((.(..(((((((.((((((((.....................(((((((..(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...)))))...)))))))..((((((((((((.....((((..(((.(((.((...((..(((..(((((((((((((.((((......((((((((((...))))))))))......)))).(((((((((...((.(((.(((..((((((((..(((((((((.......))))...)))))..))))))))...))).))).))..((((....))))....(((((((((((.((........(((((((.(....(((((.(((..((((((....(((......))).))))))..................((((((.(..((((.......))))..).))))))((((((.((((.....)))).....)))))).....(((((((((((((((.........((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).))))))((((((..(((...(((...((.((...((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))......(((....))).)).))...)))..)))..))))))...))))))))).))))))))).)))))).)))))))((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))...)).))))))).)))).......(((((..((..((((..((((....(((((.((((.((((((.(.....((((..((((.....))))..)))).((((((((....((...(((((.((((.(((....))).))))(((....))).)))))......))....))))))))).)))))).((..(((....)))..))..)))).)))))...))))..)))).))..)))))..........((((.......)))).))))))))).....(((....((..((((..((((...((((((((((.((((((...((((.((((((((.((......)))))).)))).................((((.(((....))).)))).))))..)))))).))...))))))))..))))...)))).))....)))......((((.((((.((((((.....)))))).)))))))))))))))))).)))..)))..)).))))).)))..)))).(((((......)))))...((((((((((((.((.((((...((((((....((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..)))))))))).)))))).)).(((.(((((......))))).))).(((((..........))))).......)))..)))))))...))))))))))))..(((((((((((((.((.....)).)))))))....)))))).....((((.(((((.....(((((......((...(((((..(((((((((....))))..))))))))))....)))))))))))).))))......................)))))))).)))))))))))))..(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))))))).))))))).......(((.(((((.((((....))))))))).)))...........))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((((.((((((.({....),))))))))))..)))..)(....(((((({((((((..(((((.,,{((((({{((.(((,(((.{(..(((((.(((((((.,,.,..,,....,)....,,))))))).))))).....))..,)).))).))))))))|,,.....,.((((.(((..{.{.((({..((((((((...{({{({.....||..)),,.))))))))...)))).}.)..))).)))).,{{,.(((((((((((,{,(((,.||.....,),.),,...,|.(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))..}}..(((({.{..(((((((.((((((((......,,,,.,.(((((((.(((((((,.(((((.((((........)))).....(((((...((.....)).....)))))...))))).,.))))))...}.))))))),|,..{{{{||||,{{(({{({.{,,.{{..(((,{{((((((((((((.{(((......((((((((((...))))))))))......)))}.(((((((((...(((((,{{,((((((((((({{,(((,,(((...}}}.,))).})))))}{{,||{(((((......}.))))}}||||....}},,,,..(((((((((((,({.....,},{((((((,{....{(((,.((...((((((....(((......))}.))))))............,,,..,{(((((.{..((((.......))))..}.)))))|((((({.{(((.....}}))....,}}})))}},.{(((((((((((((((,,{{,..,((({((,..{((((({..,(,,,...{(((((..{(,,......}},,||||||,((.(,({{..,},.))).,.}}..{,...}}..}}}}})}))}}}},...,.,{{|,..})),.......{{..((((((((..((((..{({....,..}}}.({((((((((........(((((((,,.,{,{{.(((,.,(((..,..(((((((...))))))),}))))})).}),.)))))))))).))))}.))....))))..)))).))))..}}..|||,...}))}}).}}.}}..,..,.,,}))})),,,.))))))))).)))))))}}|)))}}}.}))}))|((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).))))))),..,,.})))))},))))..,..,}}||||..,...((((..((((..{.(((((.((((,{({{......,..{{{{,..{{({,,,,||}|||||,,.(((({{{{....,{,,.({{{{.((((.(((....))).))))|||....))).)))))......,,....}})))}}}.,||,|||.||},|||,}}.,}}.})),.)))}.)))))...))))..)))),|,{{{,,,}}}.}}},,.))))}.,||,..,.,},))))))))).....(((....((..{(((..({{{...{(((((({((.((((((...,{{{.((((((((.((......)))))).)))}...............,.((((.(((....))).)))).),,,..)))))).))...)))))))}..))))...)}},.))....)))......(((,{((((.((((((.....)))))).))))))))))))))))))})}}..}}},{{..{.(((((.((({{((..{(.((((..(((((((.(((({,,,{{,|}((((.{,.......,,)))).((((({....)))))),.....((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))({{...})).|(((({{{((((((((((.((((({.,({...{((((..........))))}...{{....(((......)))..,)).))..))).))).)))))))))},}),)))})))).))))))).)))).}}..))))))))))).}..}}},,,,.,,,...}))))}}|,,,||((({{{{{..,,|,,||||||}|,}}}},,,}},}},}}}}}}}))}........................)))))))).)))))))})))))..(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))))))).))))))}.......{{{.{(({{.{{{|....}}}}))))).}}),..,,,...,,))))))...)
Forensic Context

No forensic context available.