Basic Information

Symbol
hsa_PVT1_0001900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0085543 hsa_circPVT1_008 hsa-PVT1_0050
Host gene
PVT1
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
8:128902835-129001537 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:127890589-127989291 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-338.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -356.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........)))(((((((.............(((.((.(((((.((((((.(((((((..((.((((((((.....))))....)))).)))))))))...)))))).))))).)).)))(((((((....((((((((((((..((((((((((((...(......)...))))))))..........(((.(((..(((((((((((((((...(.(((((((((((((........))).)))))))))).)....)).))))))).((..(((..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..)))))...((((((..(........)..)))))).....))))))...))).)))....)))).)))))).)))))).((((((.......))))))......)))))))..)))))).(((.(((((...((((((((((.(.......((((.......(((((((.(((.(((((........))))).))).))).))))))))((.(((((..(.(((((..(((((((((((((((((....((((((((.....))))))))((.((((((.((.(((..(((((...((((.((.....(((((((..(((((.........)))))..))))))).)).)))).((((..(....)..)))))))))...))).)).)))))).))))))))................)))))))..))))...))))).)..))))).)).((((..........))))....(((((((...(((.(((......))).)))...))))))).).)))).))))))))))))))..((((((..((....)).))))))..((((((((.......))))))))......(((((((((...(((((((.(...((((..((((...((((((.........))))))....))).)..))))...).))))))).)))))))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{{{{,{{{}}|{.,,|||}||||,.{{{{.{(((..(((.((((((((((((,(((({{((({{((.,{({{,,,,,.{{{{{{{||||,|((((.{((((......))))))))).),||,|||||}},.|{{{{{{||{{|,,|||||{{{,,{{...,.{{{{,|{{,||||||||{,..,,...,|}|{(({{,{((((((((((((((...{.(((((((((((((........))).)))))))))).}....)).))))))).((..{((..(((.(((((((..(....)..))))))).)))..))))),,.((((((,,{...,,...}..)))))).|,.,|,}||||||},||||||.,,}})}.}}}})),)}))}),{{{|||,,,...,)))})}.....,)))))))}|)}..}}}}.))))}||})))|))|}...)))},...,})))))).))).))))}}}}{((.(((((.,,...,,))))).))}.||({{||..}}}{{,|||||,.{.(((((..(((({{{{{{{((({((.,..((((((((.....)))))))){{.{{{{({,((,{(({.{({{{,,,((({.((....,(((((((,.(((((.........))))),.}))))})|}}.})}},((((..{....)..))))))))}.},}}}.)).)))))}.||||||||,,,,,,,,..,,....))))))),,))))...))))}.,,,))))),)),((((..,....,..))))....(((((((...(((.{((|....,))).)))...)))))))|}|}}||||||,|{|.,,,)))..|||||{..({....}}.)))))){,({{,,|||.....}}}))))))}.)})}}|((((((((.{{{{{((((.,...((((..{(((...((((((.........))))))....))).}..))))...}.))))))).))))))))}.....,)
Forensic Context

No forensic context available.