Basic Information

Symbol
hsa_HECTD1_0031200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECTD1_0308
Host gene
HECTD1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
14:31611064-31615981 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31141858-31146775 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-540.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -581.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 420.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...))(..((((...((((.....(((((......)))))....))))....(((.........)))(((((((..((((((((.(((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((.....(((.........))).....))).))).)))))..(((..(((((((((.(((((((((((...(((((((.............((((.(((((........((((((.(.........(((......)))..................((((((((((((.((......))..)))))))...)))))....).))))))((((((((...))))))))))))).)))))))))))..))))))............((.(((((((((...((((((((.......((((...((((...(((((.......))))).))))..)))).....))))))))..))))))))).))))))).(((((((((.((((((............)))).)).)))))))))....(((((((((((((.....((((((...(((((((((((((....(((((.(((.((((((.(((((((((((((((((((.(((.....(((.(((.....((((...((((...((((((((((......((((((...)))))).....))......(((.(((((((((((((..(((..((........))..)))..)))))((((......)))).)))))))).)))...........))))))))...))))..))))))).)))....))).)))))))....))))((((((..(((....(((.(((((((((((....(((((...))))).))))))............))))).)))....)))...))))))((..((((...((((((((((((..((((((...............((((((.((((..((...))..))))..)))))).(((((.(.(((..((.((((.......(((((((........)))))))...(((((..((((..((((....))))..))))..)))))................((((.(((.((..((((.((((.....))))..))))..)).))).))))....)))).))..)))).))))).........((((((((((((....)))))..)).)))))....((((((......)))))).......)))))))))))))))))).))))..))..(((((((((((..(((.((((.((((((((..((......))..))))..)))).))))))).((((.((.....(((((.(.....).)))))))))))......(((((((((...))))))))).........((((((((((....)))).))))))...........((((..((((.......))))))))......(((((((.((((.(((((.((((.....))))...))))).)))).)))))))((.((.(((((((.(((((((((..(((((((..((((...(((((.....))))).....))))......(((((((((.......))))).))))....))))))).)))))))))..........((((((((....))))))))))))))).))..))(((((((....)))))))..((((....)))).....))))))))))).)))))))).)))))).))).)))))...)))))..))))))))...))))))....)))))))))))))..((((((((...((((((((...((((((((.........))).).))))((((((((((((..........(((.(.((((((((....))))..............((((((((..(((...(((...........)))...)))..)).)))))).((....)))))).).)))..........))))))))))))........))))))))....)))))))).(((((.(((((.....)))))))))).))))))))))))....(((((........))))).......))))))).........)))))).((.(((....)))))..((((((.(.....).))))))...))).))))).))))))))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...}}(..,,({|{{({,...,..(((((......)))))...,}))}|.,.{{{.....,,..)))(((((((..((((((((.(((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((.....(((.........))).....))).)))}}))))..(({..(((((((((.(((((((((((.,.(((((({............,((((.(((((..((({{.{({{,(((({{,.....(((......)))..................{{{{,,((((((.((......))..))))))|...}))},...,}.,.))),,||||}|}...))))))..))))).)))))))))))..))))))............{{.(((((((((...((((((((.......((((...((((...((({{.......}))}}.)))}..)))).....))))))))..))))))))).})))))).(((((((((.((((((............)))).)).)))))))))....(((((((((((((.....((((((...(((((((({((((....{((((.{((.((((((.(((((((({({{(((((((.(((.....(((.(((.....{(((,..((((...((((((((((......{(((({...)))))}.....}},,....(((.(((((((({((((..{{{..,,........,,..,}}..))))}((({......)))).)))))))).)))...........,}))))))...)))),,))}}))).)))....))).)))))))....)}}}((((((..(((....(((.(((((((((((....(((((...))))).)))))),..........,))))).)))....)))...))))))((..((({...((((((((((((..{(((({......,,,,.....|{{{((.{{{{.,{{...}}..})}}|,||}}}|.{((((.(.(((..((.((((.......(((((((........)))))))...(((((..((((..((({....})))..))))..)))))................{(((.(((.((..((((.((((.....))))..))))..}}.))).)))}....)))).))..)))}.))))},...,,}},((((((((((((....)))))..)).)))))....((((((......))))))..,,,,,}}}}},}))))))))))).))))..))..(((((((((((..(({{((((.((((((((..((......))..))))}.}))).))))))).{((||{{.....(((((.(.....).))))))))))}......(((((((({...})))))))).........((((((((((....))))}})))))........,..{(((.,({{{,.....,)},})))}......(((((((.{(({.(((((.(({{,....}}}},..))))).}))).)))))))((.({.(((((((.(((((((((..(((((((..{(((...(((((.....))))).....))))......(((((((((.......))))).))))....))))))).)))))))))..........((((((({....})))))))))))))).,},.))(((((((....)))))))..((((....)))).....))))))))))).)))))))).)))))).})),)))})...))))}..))))))))...))))))....)))))))))))))..((((((((...((((((((...{(((((((,......,.))).).)))|((((((((((((.....,,,..(((.(.((((.((,....||||{.....{,,.,..,(((.,,.,}}||,.,,|||.....,{{{{{{{.........)))))})))}))}...}))))).).)))......},..)))))))))))),.......))))))))....)))))))).(((({,(((((.....)))))))))).))))))))))))....(((((........))))).......))))))).........))))))..{.{{{...,),,,,..{{{{((,(,,....,))))),...))).))))).))))))))}))))))})),.)
Forensic Context

No forensic context available.