ForensicRNA
Home
Atlas
Index
MH Mapper
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PTK2_0010900
Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0010900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0135893
hsa_circPTK2_109
hsa-PTK2_0171
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141727697-141754866
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140717598-140744767
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-175.5
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-186.9
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
74.2
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((((......(((((((.(((..(((((....(((((..........)))))))))).)))....)))).)))..((((((.........)))))).....(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))....((..((((((.((.(((((((((((((((.......((((((...(((.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..))))))))..)).....)))))))((...(((((....))))).((((.((((....((((((((..((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...))))))).))........)))).)))).)).....))).)))))(((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)).(((((.((.((((.((........)).))))...)).))))).........)))))))))).......)))))))))..(((((((....((((........))))...))))))))))))))........))))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((((((......,(({{((.(((..(((((....(((((..........)))))))))).)))....))}}.}},..((((((.........)))))).....(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))),,.{((..((((((.{,.(((((((((((((((.......((((((...(({.....)))....)))))).(((.......))).......)))))).)))))))))..}}))))))..))}....)))))))((...(((((....))))).((((.((((..,{((((((((.,((.((((((((.....(((((((((.((.(((...(((....)))..))).))...)))))),.})),......)))),,))).)).,...)))}}))))|((((((....(((((((.((...((((((((((....((((....)).)){(((((.{{.((((.((........)).))))...,,.))))).,.......)))))))))).......)))))))))..((((((({{..((((........))))}},)))))))))))))|,....,,.)))))))),.))
Forensic Context
No forensic context available.