Basic Information

Symbol
hsa_HECW2_0010500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0057593 hsa_circHECW2_005
Host gene
HECW2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:197185063-197298182 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:196320339-196433458 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-319.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -337.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 282.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((....((((((((((.((.(((((((((........((((..((((((((((..((((..(((((..........)))))....))))..)))).......((((((.....((((((((.....))..((((........))))...(((.(((((..(..(((...((((.....))))....))).)..))))).)))........(((((.((((....)))).)))))))))))(((((((..........)))))))..........))))))(((.(((((...((((.(((((.....((((....))))......)))))))))...))))).))).........))))))..))))...........((((((((...(.((((((..((((((((((((......((((((.(((........))))))))).......((((.......))))..((((.((.(((.(..(((((..((((((.((..........)).))))))..)))))..)..))).)).))))))).)).)))))....))..)))))).)........((((((...((((((.........)))))).))))))((((((((((((((((((..(((((...((((((....)))).......)).)))))..))))))).(((((((..((((((.....))))))..)).)))))(((.((((......))))..))).((((......)))).............)))))))))))..............((((((.((........)).))))))))))))))...))))))))).)).....)).))))))))((((........))))........))))))..(((((....(((...))).......)))))..)))))).(((((((((((((.((((.((.((...)).)))))).(((((((........)))))))...))))))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{{{{{(((((((...(((((((((((.((.(((((((((..,...{{(({(((((((((((((..((((..(((((..........)))))....))))..))))........{(((({..{{,{(({{(({{{{.{(({,{{,{({...,,,.{{.{(((,.,(,({.{{..{((..{((((..{{{|}}}..{{||},{,||||||{|||{{,...{.(((((.((((....)))).))))),),,.|(((((((..........)))))))..........))))})||,.(((((.,.((((.(((((.,{,.(({{....)))),.....)))))))))...))))).,)),.,,,,}}}))))))..))))..}.,....}}||||,,||.,.}}}...,|.}}}}||||}}((........}},,,|{{(,,,.....))))}},,........,,,,}}},...|))),}((((.((.(((.{..(((((..((((((.((,.......,.)).))))))..)))))..}..))).)).)))})))})))}},||...,||,..,{{{,{,....,{,{{{{{{{.,,{{({{{.,,...,.,)))})),)))))}}{{,,,((((((((((((..(((((.,.,,({,,....),}}........,.)))))..)))))))){{{||||..{{{,((|||..},))))}.||,}}|}}(((.((((......))))..))).{|{{,,,...||||,,.,{{{{{,....,,,}))))}}},...||....,},{(((((.{{........}}.))))))..,,)))),,.))))))))).)).....)).))))))))|{{{........}}}}........))))))},(((({....(((...))).......,)))),,}|,}}}.|,{{(((((((((.|{{,,|{.{({{{,,.,))))|{(((((((.,....,.))))))},}}))))))))}},,,},))
Forensic Context

No forensic context available.