Basic Information

Symbol
hsa_HECW2_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECW2_0078
Host gene
HECW2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:197106808-197171957 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:196242084-196307233 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-284.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -306.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 374.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((.(((..((((.....)))...)..))).))).........)))).)))))((((((((((.(((((....))))).))..((....))...(((((....)))))....)))))))).((((.((((((.((((((.(......).)).....((((((..((.(((((((((((((...((((...........((.(((.((((((((......((((.....))))((((.((((((.....))))))))))..........((((((..((.(((...))).))))))))...(((...))).....(((((.(.((((((....))).))).).)))))..........))))).))).))).)).(((((.(((...)))..)).)))))))..(((.(((.(((((...))))).((((((...........(((((.......((((........)))).............(((((((((...((((((.....((((..(((..((((((((((.(((.(((((((((((((((....)))).......(((..((((((((((((((.(((..(((.(((..(((((....(((((((((((((...((((.....))))....)))))))))..))))......(((((........).)))).........)))))....))).)))..)))..((((.......))))..........(((((((..((((...)))).)))...)))).))))....))))))))))..)))....(((((((((.....)))...))))))((..((((((.......))))))..))(((((((....)))))))...............))))).)))..)))))))))))).....))))..)))..)))).....))).)))..))))))))))))))...((((....)))).......))))))....))))))....)))))))).))))).))......))))))...)))).))))...))...))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{(({,((,(((.{{(..({,{.....,||.,.|,.|||.|||.....,...|}|}.||||{((((({((((.(((((,{{.||},}.,,..|,.,}}|}.|.{({{{...,||||}.,.{||||||||,{{{,.,,{{,,,|{{{,|}|,,..,,|,|||,...{{{{{{,,,{,(((((({{{(((,...{{,,.|||,,|}}}}|,{{{{,(({{{........}||||.....||{(((((.((((((.....)))))),))})},}}.....((((((..((.(((...))).))))))))...(((...))).....(((({.(,((((((....}}}.,}}.|,|}}}}......((((....))))..|||{||{{|{|,.{(({{{..|,.....,.|||,..{{,..,{.,{(((,..,,},,.,})}||.....,..}}}}}}}.,}}}}},((((........)))).}..}}},,}}}}|{||||{||},..,||||,,,..|||{..{(({..,{{,|||{{,{{||(((((|{{{{(((({....}))){{{{{..(((.,((((((((((((((.(((..(((.(((..{{((,....(((((((((((((.,.((((.....))))....)))))))))..)))).{{{{,((((,.,......,.}}},.},,,}}}}}})}}....})).))),.)))..((((.......))))..........{{{{(({.,{,,,....,}}.)))...}))}.))))....))))))))))..))),{{{{(((({(({{.,.,}))...))))))}}},{({(((.......))}}})})))(((((((....))))))),},,}},}}}}},.}),})))),,,}}||}}}|}|||},,.|||||||.,,|||||||..,,,||,.(({{(,,.,,)))))..,}}..{(((,,,.}|||{,.....},))).....}.,}}}...,))))))|||||}}}.)),,),..}}}}}}...}))},))),..,))}},,)))........
Forensic Context

No forensic context available.