Basic Information

Symbol
hsa_HECW2_0004600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HECW2_0132
Host gene
HECW2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:197117298-197118753 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:196252574-196254029 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-374.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -405.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 483.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((((..(((..(((((.(((((((....)))))))..(((((((((((((((.((((((((((.....(((((.....((.(((.(((((((((..((((((((((....)))))).........))))....)))))))))))))).....)))))..((((((((((((.....((((((((((.((((((...(((...)))...)))))).)))).(((((........))))).....)))))).....)))....(((((((..((((((((((((.((.....)).)))))))..((......(((((((((((...(((.....((......)).....))))))))))))))......))...........(((((((..((((((((....))))))))))))))).(((((.(((((((.((.....)).))))..))))))))..))))).)))))))...(((((.......(((((......)))))......)))))(((((((....)))))))...))))))))).....)))))))))).....(.(((((..((((...)))).))))).).((((((((((((((...)))))))).....))))))......(.((((..(((((..((((.((((((..((..((.((((........)))).))..)).(((((.......))))).((((......)))).((((((((..(((.(((((.......))))).))).)))..))))).((((((.((....((((..........))))....)).))))))....((((((((((((..((((...(((((((.(((.(((.........(((((....)))))..........))).))).)))))))....))))...(((....)))....(((((.((......)).))))).)))))....))))))))))))).)))).)))))..)))).)....(((((...(.(((((...((((((.........(((((....)))))))))))..))))))...)))))...........(((((...(((....(((..(((......)))..)))....)))..)))))(((.(((((......))))).))))))))))).)))))))...............(((((((((((................(((((..(((((....)).............((((((.......))))))..((.(((((...(((((...........)))))..))))).)))))..))))).......)))))))))))((.((((((((.((((...)))).))))))))..)).)))))..)))..)))).......((((((......(((((((....)).)))))......))).)))))((((...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(({(((.......)}}}}|{{{.|((((((,{{{{({{{(({{(((((((((((((((.(((,.{{((((((,{(({{((((,({{.(({{({,{{(((({{({((((((((....)))))},,||{{||,||||{{{{||||||||||||,,..{(,.{(({,,{{{{{,(((((((,...((((((((((.((((((...(((...}))...)))))).)))).(((((........))))).....)))))).(({{(.....}}}}}.{((....))|((((((.((.....)).))))))).))))))}..{((((((((((|.,||{|{...{|,...,,}}..},.|}))))))))))))..,}}}}},||(((((.....(((((((((((.(((((.{{{{{,{{((({,,.,.{{|||||||||{{.,,.....,,.,}}|.,}})))))}..,,,{,||........,.{{{||{{,..,{||||||||..,}}})}}))})},},((((((((((((..{{{............}},.)))))))),})))......,,.))))).)))))))))))..))))).{{{{({((((((({...}))))))).,.,,))))})..,||||.||||,,{||||.,{{||,,|||{|,||,..||,|,||,..,||,{||||{||.,{|,(((((.......))))).(({|,...,,|||},({{{{(((..(((.((({{..,.,..}}}}),))}.))),||||||.,,,,,,.||||||||}...(((((({....)))))))...||||,...((((((((((((..((((...(((((((.(((.(((.,,,.....(((((....)))))......,},.))).))).)))))))....})))...(((....)))....{{(((,{{.....,}),)}})}.)))))....)))))))}}}}},.}})),})))).,))))...,,...||||..{{{{{(({{{............,,{(((((....))))))|||||{{}|{|||,,,{,||,.||,....,,.})))}},,)))))}}))},|||||}..,,},.,,.})},..,)))}),}||||)}||}|,......,,))..))})))))))).)))))))|,|||||...,,,...}}},.,||||,,.,....((((.(((((((((.((.{(.((.((...,,.((({,..{{||||,,{.{{{,|||||.{(,{(,..(((((..{{{({,,,{.......((((((..((((((({.{((((........))))).}.)))))))..)))))),,....,}))})}..))))),}}}|}}}}},))).}))))).,}...))))}).))))))))))).)))}.},..})))),.))))).)),.))))),}))))}
Forensic Context

No forensic context available.