Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0017900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0135900 hsa_circPTK2_101 hsa-PTK2_0032
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141753329-141762415 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140743230-140752316 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-98.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -105.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(....)..(((((((....))...........((((..(((((.((((((.(..(.(((((((....)))).))).)..)))..........((((((((.((.((......)).)).)))))))).(((...(((.(((((..(((((((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((....(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))).....))).....)))))..))))))))..))).........)))))))))..))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,....|..((((({{,{{{,,........,..((({..(((((.(((({{.,.,{,(((((((....})))}}}}.}..}})......,,,,{(((((((.((.{{......,}.)).))))))||{((.{{.(((.(((((..(((({((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((,...(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..}},)}}.....)))))..)))))))).}),))},,.....)))))))))..))))..)))))
Forensic Context

No forensic context available.