Basic Information
Symbol
hsa_PTK2_0018500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0135902
hsa_circPTK2_094
hsa-PTK2_0082
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141753329-141774389
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140743230-140764290
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-130.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-141.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
123.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.......))))))...((.(((((.((((....(((((.((............))...........(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..(((((((((...(((((...((((.((((((........))))))......((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).))).)))..))).)))).....((((((....))))))))))..)))))..)))))))))(((((.((.((......)).)).))))).(((((.((.(((.(((((..(((((((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((....(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...))))).....))).....)))))..)))))))).)).))))).))))).....))))))).)).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{(({{{{...,{,,|,||||.,.{{{{(,.,.,.||}...((((({.........)},})))....,......(((((..((((....(((.....)))...))))..))))).,(((((((((...(((((...{(((((((,((...,,...}|}|||..,{{.((((.(((....(((.(((.((((((........))).))).})).)))..})).))))..},}||||||....},)))))))}..)))))..))))))))){{{{{.{{.{|..,,.,,},)).))))),|{{{{,||,|||.(((((..(((({((((((((..((.((((((((((..(((((.((((.((....)).)))).))))).(((..(((((....(((((..........)))))))))).))).........))))))))))))..))))))))..(((,...(((((.((((.((((((((.(.....).)))))))).))))...)))))..}},)}}.....)))))..)))))}||,||{||}},...,}}..},}}}}.}}}.}}......
Forensic Context
No forensic context available.