Basic Information

Symbol
hsa_HERC1_0038700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104147 hsa_circHERC1_173 hsa-HERC1_0173
Host gene
HERC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:63966541-63967292 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:63674342-63675093 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-206.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -219.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.