Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0021500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0085752 hsa_circPTK2_030 hsa-PTK2_0034
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141762331-141900868 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140752232-140890769 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-362.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -394.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 456.0
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.....)))....((.(((.......((((.((((((((..............((((((((..........)))))))).....((((((.((((((.((((((((((..(((((((....(((((((..............(.((((((......)))))))((((.((.(((.........))))).))))...(((.((((...((((.....((((((((((.((............((((....))))............((((((((((((((......))....(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..)))))))..(((.......((((((.(.((((((((....((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((....)).)))))))..)))........)))))))))((((((((.......))))(((.(((((((((.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).............((((...(((((...((....))....)))))))))..(((...((.((((....)))).))..))))))))))))))))))))))))))))).((((((....))))))....(((((.....).))))........))))))))))))))).......)))(((.(((......((((..((.(((((((..(((((..........))))).....))))))).)))))).......))).)))...........))))))))).)))..)))))))))))).....)))))))).)))..))))))))))))))..(((.((((((.....))))).).)))(((((.(((........)))))))).))))).)))))))).)))...((.((((((.....)))))).))....(((((.((((((....((.....))..(((.((......)).)))(((((.((((((........))))...)).)))))......(((((......))).))((((((..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).))).)))....)))))))))))((((((........))))))...))))))(((((.......))))))))))))).))))...(((((.....(((.....)))...)))))(((((....)))))...))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,({,,{,,,..,,.({,|||.},....,.(({(((((((,({{((((.......((((((((..........)))))))),,,..,{{{{..{{||||.{||||{,{{,..(((((((....(((((((..............{.((((((......))))))}{(((.((.{((,......,})}})).)))}..,(((.((((..,((((.,,,.{(((((((((,{{..,,....,},.((({....||||.........,.,{||{(((((((((,((((({{{((.{((((((,,,|,.,,.},}}}},|,|{||{(((({|{(((({{,{(((((((((((((((((({(((((....}}}).))).)}|,(({.....,))),,{{(((((((...})))))}.}}||(((....{.{(((((,...(((....))).{(((((.((((((((((({{(((({.,((..,.}}|||,}|((,{((....,,,...,,}.})),.)},.,},},..}}}}))}},,})))))))))).)))))))))))}.})))},)))))))}}})))))),{{,...((((((.((...((((((..,((,...,,,..},|...((((((((((..,..((({,{({{{((({{((.(({{,,(((((({{.((..((,,......||..},....,|}}}},..},}}.})))).....{{(((,..(({...,}||,{,.,((((({((...,{{|{{{({((,.((({...,||||,.}))},},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..,,.}}})))}))}}}..|||...,,,..))))))..,,..))}.)))))))...))))))..)).))))))..}}...}.}})))},..,.)))))).}..,}}}.,,...))))).),..........})))))))).)))..},)))))))))),,,..)))))))).))}..))))))))))))))..(((.((((((.....))))).).)))(((((((((,{{,....},,,,})).))}})}))))),)),},,....})))))).}}}})}.)))))}.....((((((((((((....((.....))..(((.{({(......}))|{(((({((,{{{...,}},,,}}}..,})}}},}}...,,,||{{{......))}.,.((({{{..((..(((((..((((....(((.....)))...))))..)))))..)).)}},}))....)))))))))))|{{|||.,.,..,|||,|||...,,.|||(,(((....{{{,|||,||||||,,......}}}.}}}.,,,.}}),.}}}.}))).,,.{((((((....))))))},.},.)))}
Forensic Context

No forensic context available.