Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0000900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0102312 hsa_circHIF1A_005 hsa-HIF1A_0023
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62187097-62201003 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61720379-61734285 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-230.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -250.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....((...((((.((((.........(((((((((........))))))).)).........)).)).))))...))...))))((((((((((((((..(((((......((.((..((((((((...(((((((......)))))))..(((..((.....))..)))((....)).(((..((.((((((((((..((.((((.(((.(((((.....((((((((.....))))))))((((((......))))))(((.((((.....(((((((((((.(((((.((((((((......))))))))(((((((((.(..((....(((((......)))))))..).)))))))))............))))).))).(((((((.(((((((((.((((.....((....))(((((.......)))))....................)))).)))))))))......((((((.....(((..(((.(..(((.((..........)))))....).)))..)))..))))))((....))....((((((.((..(.(((((((((.........(((..((((..........))))...))).))).)))))))..)).))))))....)))))))((((((((...(((.(((((.((((.((((.((((.((((.((((.(......).))))....))))...)))).))))..)))).)))))..))).))))))))......(((((((....)))).)))...((((..(((((......)))))..))))......)))))))))))).)))...))))).))).)))).)).....))))))))))))...)))..))))))))..))))......)))))..))..(((((....))))).))))))).((((((((((((..................)))..)))))))))...........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((,...,{{{{,.,,.{{{,..,|,,..,||{((((((........))))))|{,,.{{{{{{{{{...,.))))}}})}..})}}}{((({(((({{(((.,((({(,,..,|((,((..(({{{{((,,.(((((((......)))))))..{||||((.....)),,}}}{||,..,,,{{{,.{|,((((((((((..{,,({{{.(((.{((((,,,,,{{{{{{{{.,,,,)))))}}}((((((......))))))(((.((((.....(((((((((((.(((((.((((((((......)))))))}{{{{{{{{(,(,.....,|(((((......}))))}...),))}}))))),...........))))).))),|((((({.(((((((({.((({.|.,.{,....||(((((,,,....}}|||.................,.,)))).))))))))}...,{.((((((...,.{((..(((.(..((,,((.,........)))))....).)))..)))..)))))).}}.,|}},,,.{{{{{(,{{..,,|||,,.((((,,((((..,(({.(((({{........,,)))}})},.})).))))))))),,.})))},.,,.))))))}((((((((...{{{.(((((.((({.{{{{.{(((.{{{{.{{{{,{......}.}}}},...))}}...)))}.})))..}))).))))).,,}}.))))))))....{.((({(({....}))).)))},.{(((..(((((......)))))..))))......}))))))))))).))).,,))))),})),))}}.,...,,.)))))))))}},...}}},.}}))}))),,))),.....}))))},,)),,||({{,,..}}}}}.})}}))}{{{{{{{{{.{{,,....,,,,.,.....,,}}}..,})))))))))}.....}}})))))
Forensic Context

No forensic context available.