Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0003300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0102318 hsa_circHIF1A_017 hsa-HIF1A_0039
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62188227-62203827 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61721509-61737109 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-228.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -249.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 262.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((((((....(((((.(((((((((.........)))))))))...((((((......))))))(((.((((.....(((((((((((.(((((.((((((((......))))))))(((((((((.(..((....(((((......)))))))..).)))))))))............))))).))).(((((((.(((((((((.((((.....((....))(((((.......)))))....................)))).)))))))))......((((((.....(((..(((.(..(((.((..........)))))....).)))..)))..))))))((....))....((((((.((..(.(((((((((.........(((..((((..........))))...))).))).)))))))..)).))))))....)))))))((((((((...(((.(((((.((((.((((.((((.((((.((((.(......).))))....))))...)))).))))..)))).)))))..))).))))))))......(((((((....)))).)))...((((..(((((......)))))..))))......)))))))))))).))))))))..((((((((((((...((.(((((..((.............))..)))))))......)))))))))))).(((..((((.((((((...(((.....((((.((((....(((.((((((((((((...)))).))))......)))).))))))).))))...))).).))))).)))).)))(((........))).))))))....))(((((((((((..((((((((...((.((((((.......((((((((((.((..((..........(((.(((((.....))))).)))...))..)).))))))))))..(((....)))))).))).))...))))))))..)))))....))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,,,,(((((({{{,(((({,(((((((({.,.......})))))))).,,((((((......))))))(((.((((.....(((((((((((.(((((.((((((((......)))))))}((((((({(,(,.....,|{((((....,.}||||}...),))}})))))............))))).))),{((((({.(((((((((.((((.,.,.{,....||(((((,,,....}}}||.................,.,)))).)))))))))...,{.((((((...,.{((..(((.(..((,,((.,........)))))....).)))..)))..)))))).|}..||,..,.{{{{{(,{{..,,|||,,,((((,,((((..,(({.(((({{........,,)))}})},.})).))))))))).,.})))},..,.))))))}((((((((...{{(.(((((.((((.((((.((((.((((.{(((.(......).)))),...))))...)))).))))..)))).)))))..}}}.))))))))....{.((({(((....}))).)))},.{(((..(((((......)))))..))))......}))))))))))).)))}}})),,|{{||{|||{{{...{{.||||||||(,,......,,...)}.|||}}|||,.....||||}||||||}.(((,,((({.{((((|..,{{{.,,,,{{{,,{{{.....{{{.{{{{{{{{|{{{.,,}}}}}))}}|,,,..||||{|}}|||,.,}}},}},)),),))))).)))).}})|||,.......},,.))))))....)){{{{{((((((..((((((((...((.((((((.......(((((((((({(({.,,......,,..((({(({{,.....}}))).))).,,))},),.})))))))))..(((....))))))}})).))...))))))))..))))),,,,)))),.))
Forensic Context

No forensic context available.