Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0008300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0006326 hsa_circHIF1A_031 hsa-HIF1A_0030
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62207223-62207906 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61740505-61741188 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-105.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -115.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......((((.(.(......(((((((((((((...(((((.((((.....(((((......)))))(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))))...............((..(((((((((...............(((((..(((((.((((((..((((.((..........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..(((....(((((..(((((...................))))))))))....)))...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).)))))...)))))...)))))))))..)).............................)))).)))))..))))))))))))).....).).))))...........((((((((.(....((..((...((..(((........)))..))...))..))....).)))..))))).)(((((...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,....((((...{,,....(((((((((((((.,.(((((.((((,,.,.{{{{{..,,|,},,||(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))),}}|......,...,,((..(((((((((.,,....,,,..,,,,,{{|},{((((.((((((..((((.{{.,........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..{((....(((((..(((((..{{........}}.....))))))))))....})}...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).))))}...}},,)...)))))))))..)).,.........................,})))).))))).,))))))))))))).|||.,.,.)))).{.,,,.....,,{|||||,|....{(,.((,..{,..,(({,{,....}}}..},...},..},,,..,,)))..)))))})|||||}.}),,,,
Forensic Context

No forensic context available.