Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIF1A_0040
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
14:62168614-62175710 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61701896-61708992 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-126.25 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -127.43 kcal/mol
Frequency: 0.1467
Diversity: 3.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.