Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIF1A_0046
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62187097-62207906 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61720379-61741188 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-472.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -512.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 586.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((...((((...........))))..))))((((((........))))))((...(((((((((.....)))))))))..))....((((((((..(((.((((.((((.(((((((..((....((((.(((((((......)))))))...)))))).))))))))))).)))).....)))..))))))))...............((((.(.(((((((((((((...((((((....))))))((((((((((((((((.((((.........((((..(((..((.((((((((......))))))))))..(((.((((((((.(((((..((((((.((((....))))(((((((((.....((((..((((((..(((.((...(((((((((.((((.....((....))(((((.......)))))....................)))).)))))))))...((.((((((.....(((..(((.(..(((.((..........)))))....).)))..)))..)))))).))....)).)))))))))..))))................(((.(((.(((((((((((((...((..(((((((.(((((.((((((((((....)))..((((((((((((...(((.(((((.((((.((((.((((.((((.((((.(......).))))....))))...)))).))))..)))).)))))..))).))))))))...)))).((((.((....(((((..(.((((..(((((......)))))..)))).)))))))).))))..............((((.(((((......))))).)))).....((...(((..(((.((((((((((...((((.((((((...(((((.........)))))...))))))..)))).............((((((((...)))).))))(((((.((((((..(((......))).)))))).))))).......(((........)))((((((......(((...((((((..((((((((...((.((((((.......((((((((((.((..((..........(((.(((((.....))))).)))...))..)).))))))))))..(((....)))))).))).))...))))))))..))))))))).......))))))....(((.....))).....(((((.((((.((((((...))))))...))))..)))))..........................)))))))).)).)))..)))...))((......))....((.(((((.....(((((.......))))).......))))).))....))))))).)))))...))).))))..))...)))))).....))).)))).))).))))))))))))(((((.(((((...))))).)))))....)))))).))))).....))))))))))).....(((((((((((((...(((((.((((.....(((((......)))))(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))))...............((..(((((((((...............(((((..(((((.((((((..((((.((..........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..(((....(((((..(((((...................))))))))))....)))...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).)))))...)))))...)))))))))..)).............................)))).)))))..))))))))))))).)))..)))).........))))))))))))..........(((........)))(((....))))))))))).............)))))))).))))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{({,..,{(({,,,,.{{....,||....}}|((((((........)))))){{,..(({{{{{{(,...,||||}}}}},.})|,,.((((((((..(((.((((.(((,{(((((((..((,...((((.(((((((......)))))))...)}}))}.}}}}))))))).)))}.....)))..)))))))},||,,.,..,,,,.,((((,(,(((((((((((((...{{{{||....)}}}))((((((((((((((((.((((,.,..,.{{{{(({{{{{,,((.((((((((......)))))))}||..{{(,((((((((.(((((..((((((.((((....))))((((((((({{,.,{{{{.|{{||,|,}|||,|{...(((((((((.((((.,.,.{,....|}{((((,,,....}}}||.................,.,)))).)))))))))...,{.((({{{.,,,.{{{..{{{.{..{{,,{{.,........}}))}....}.}))..))}..}}}}}},},..||},.|,|||,,||..,}},|||...,,||......,,{{{({{((((((.,{{{{,...{{..{{{{(((.(({{{,{(((((({{{{.....,||||,,((((((((...{{(.(((((.((((.{(((.((((.((((.{(((.(......).)))),...))))...)))).))))..)))).)))))..}}}.))))))))...{({((({{({....,})).})}.},|||,.,{(((({{,..{|||||.,|||{..,{.,,,,.}},)}))),}....,,))))})))})))}.}},,}}}}}}}))}}}},,||.,,|{,..(((.(((((((({,...(({(,{{{(({.,,((({(,...,,,.,}}}}},,.}}}}}|..}}}}..,,,,,{,|,..{{{{{{{{..,))}},))}}||||{,(({{{(,||(|,.....}}}.})})}),))),}},,.,..,||......,,|,.((((((.,,...({(,..((((((..((((((((...((.((((((.......(((((((((({(({.,,......,,..((({(({{,.....}}))).))).,,))},),.})))))))))..(((....))))))}})).))...))))))))..)))))))))....,,.))))))....|||,,,..}}}.....{((((.{{{,.(((((({{..,,)))}}}))})..)))))......,.....,,..,.........}})}))}}.}}.}})..}}}...,,||,},...}},,,.((.(((((.....(((((.......)))))...,...))))).))....,}}}}}}.}}}}}.,,|||.}}}},,)),..}))))}.,,},})),,,}},}}}.})))))))))))(((((.(((((...))))).)))))....)))))).))))).....})))))))))).....|{(((((((((((.{,({(({.((({{..{,{{{({..{{{,,,,|{(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))),}}|..,.,.}},,,,||..(((((((((.,,....,,,.,,,,{{{{|,,{((((.((((((..((((.{{.,........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..{((....(((((..(((((..{{........}}.....))))))))))....})}...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).))))}...}}}})...))))))))),.))}},.,,,,,,,......,...,.....}})))).))))),,)))))}}))))}|,||,..||,|{...,,|,,}}},,,,})}}}..,.....,.{((........))),|,....}})))))))))...,......,,,)))))))).))))),))))}...
Forensic Context

No forensic context available.