Basic Information

Symbol
hsa_HIF1A_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIF1A_0055
Host gene
HIF1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62187100-62212535 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:61720382-61745817 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-520.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -567.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 559.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....))(((..((..((((.....((((((((((........))))))((...(((((((((.....)))))))))..))((((((....(((.(((.((((.((..(((((....)))))..))...(((((((......))))))).((.(((((.....))...)))))....(((((.(.(((((((.(((((((........((((.(.(((((((((((((...((((((....))))))((((((((((((((((.((((.........((((..(((..((.((((((((......))))))))))..(((.((((((((.(((((..((((((.((((....))))(((((((((.....((((..((((((..(((.((...(((((((((.((((.....((....))(((((.......)))))....................)))).)))))))))...((.((((((.....(((..(((.(..(((.((..........)))))....).)))..)))..)))))).))....)).)))))))))..))))................(((.(((.(((((((((((((...((..(((((((.(((((.((((((((((....)))..((((((((((((...(((.(((((.((((.((((.((((.((((.((((.(......).))))....))))...)))).))))..)))).)))))..))).))))))))...)))).((((.((....(((((..(.((((..(((((......)))))..)))).)))))))).))))..............((((.(((((......))))).)))).....((...(((..(((.((((((((((...((((.((((((...(((((.........)))))...))))))..)))).............((((((((...)))).))))(((((.((((((..(((......))).)))))).))))).......(((........)))((((((......(((...((((((..((((((((...((.((((((.......((((((((((.((..((..........(((.(((((.....))))).)))...))..)).))))))))))..(((....)))))).))).))...))))))))..))))))))).......))))))....(((.....))).....(((((.((((.((((((...))))))...))))..)))))..........................)))))))).)).)))..)))...))((......))....((.(((((.....(((((.......))))).......))))).))....))))))).)))))...))).))))..))...)))))).....))).)))).))).))))))))))))(((((.(((((...))))).)))))....)))))).))))).....))))))))))).....(((((((((((((...(((((.((((.....(((((......)))))(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))))...............((..(((((((((...............(((((..(((((.((((((..((((.((..........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..(((....(((((..(((((...................))))))))))....)))...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).)))))...)))))...)))))))))..)).............................)))).)))))..))))))))))))).)))..)))).........))))))))))))..........(((........)))(((....))))))))))).............)))))))).))))).))))).........(((((........)))))..)))))))..)))))))..).)))))((((..(((((((.(((..((........))..))).))))))).))))...)))).))))))........(((.((..((...))..)).)))......(((((...(((.(..(........)..).)))....))))).((........)))))))).)))).....))))...))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((((...{{.....||....||{((((((........))))))||,,.,,......((((.((((((((.,,.({({(,((((((((({((((({,,,(({,{{{(|{{({{((((,{(({{.(((((((......)))))))..,||}}((....,}}{{|||{{{{...{{(((,.((.((((((((((..{,.((((.(((.(((((..,..((((((({.....))))))))((((((......))))))(((.((((.....(((((((((((.(((((.((((((((......)))))))}{{({((({(,(,.,...,|((({(.,,,,.}||||}...),))}}))))),...........))))).))),{((((({.(((((((((.((((.,.,.{,....||(((((,,,....}}}||.................,.,)))).)))))))))...,{.((((((...,.{((..(((.(..((,,((.,........)))))....).)))..)))..)))))),},..||,,.,.{{{{{(,{{..,,|||,,.((((,,((({..,(({.(((({{........,,))}}})},.}}).))))))))),,.})))},....))))))}((((((((...{{(.(((((.((((.((((.((((.((((.{(((.(......).)))),...))))...)))).))))..)))).)))))..}}}.))))))))....{.((({(((....}))).)))},.{(((..(((((......)))))..))))......}))))))))))).)))...))))).))).)))}.,,.....))))))))))}}.,,|||,.|||||||}{{||{......}}}}},|||{|,|{(({{({.,.|||||},}}|||,,,,,|,..}|}},.},,|||}||,,||||||||...}},,}))))}}}}}}))))|)}))))}.....|||,,,.,.}}))).,,,,....,{{........}},((((((.,,...({{,..((((((..((((((((...((.((((((.......(((((((((({(({.,,......,,..((({(({{,.....}}))).))).,,))},),.})))))))))..(((....))))))}})).))...))))))))..))))))))),...,,.))))))..})))))))).,))),...(((((.{(,,.(((((({{..,,)))}}}))}}..)))))......)))))))).)))).......{(((((...,{{..,..........,..)}...)))))}((.(((((.....(((((.......)))))...,...))))).)).......)))))))...)))(((((((((((((.,.(((((((({{(((.,(,(({.,.{{({{..,....{((((.(((((,,,|}}}|,|||||{(({.((((({,((.(,,....,),}.)))))))).)))|{{{(((((((.{,({(({.((({{..{,{{{({..{{{,,,,{{(((((((((..((((((((...........)))))))).....)))))))),}}|..,.,.}}}}},||,,(((((((((.,,....,,}.,,|,{{{{|,,(((((.((((((..((((.{{.,........(((((((((((((...(((((.......((..(((..((....))..)))..))..{((....(((((..(((((..{{........}}.....))))))))))....})}...))))).....))))))...........)))))))..)).)))))))))).))))}...}}}})...))))))))),.))}}}.,,,,,,,.............,}}))))}},)))}}..}}}}}}})}},,(((((((({..(((((...{,,.....,|,((,,{....((.{((...,....||}.......)))..)),..},.,),,,..,,)),,..))))))))))))))....{{{{....}|))|||||||||..,,...{((({...{{((.((({.({{...}}),..(((((((.(((..((.,......))..))).)))))))})))))))....))))}..........(((.((..{{...})..)).)))......,,.,,.))),))...)))))))))))).,....))))))))......{{{,,{(,.........,..}}}))))......)))))
Forensic Context

No forensic context available.