Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0002700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0082670 hsa_circHIPK2_016
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139268563-139316471 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139583817-139631725 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-564.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -597.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 381.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)(((((((((....))))))(((((..(((.((....)).))).)))))....(((((((((...(((.(((..((((((((((..........)))))))))))))(((((((.(((......))))))))))....(((((.(((..((.((((((((........((.(((((((((((........((((....))))((((.......))))......((((((((..((((.......))).)..))))))))..(((((.((((((..((((....(((((.((((......))))...)))))...))))..(((..(((.((...((.((........(((.((((((....(((.(((((....(((((..(((((((..........))))))).....(((..((((...((.(((((....(((((((.......(((......)))..........(((((...))))).........)))))))....)))))))...)))).)))..(((((((.....)))))))...((.(.(((((((......((((((...(((.............)))....)))).))(.(((((........))))).)....)))))))).))............))))).....))).))))).....)))))))))........)).))...)).)))..)))))))))...)))))..............................((.....))(((.(((.((.((((((.(((...((...))..))).)))))).)))))...)))....))))).)))))))).....))).))))).))....))).)))))......(((((((..(((.(((.....(((((.....((..((((((((.((.(((((((..(((...((.((((((....((.......))....))))))))...)))))........(((((((((((.....)))))))))))....(.((((...(((((...))))))))).).(((((.(.(((.((((.((..((((....)))).))))))))).))))))..(((((...........)))))...))))).)).))))))))..))))))).....))).)))...)))))))...............(((((....))))).....((..((((....))))..))..))))))))))))......((((((...))))))(((.((((((....))).....))).))).(((....)))..........(((((((.(...((.((((....))))))((((.((((......)))).))))(((...(((((((...((.......))(((((((((((.......))))..(((((((......))))))).((((.((((((((.((....))...)))))))).))))(((((((((....((......((((((.(((((..(....)..))))).)))))).........)).....))))).)))).((((........))))((((((.((((((..(((..((......((........))..(((......)))..........(((....(((((...)))))....))).....))..)))..))))))..((.......))......))))))(((((...)))))((((......)))).......)))))))...))))))).)))...(((((.((.(((((...)))))..((((((((((......((((......))))...)))).....)))))).))))))).).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..}(((.,.{{{...,|||(((((..(,,((||({,....},}},.|||||,...(((((((((,..(((.({,..((((((((((..........)))))))))),,,(((((((.(((......))))))))))....(((((.(((..((.((((({({........((.(((((((((((........(((({{{{{.((((...})))..{{.{(({{.....})))}.}},||,}||.,,)||{{{....,,.||..(((((.((((({..((((....(((((.((((,....,))))...)))))...)))).{(((..(((.{,...{{.{,...,....(({{((((((....,(((((({(...,(((({..(((((((.,.....,..))|||||.,,..(((..((((...((.(((((....(((((((.......{{{......,)}..........(((({...})))).........)))))))....)))))))...)))).}))..(((((((.....)))))))...,,.{.(((((((,....,{,...,...(((({...,{.,......,.}}}))))),,{.(((((........))))).,..,.)))))))).}}.,}}}}..,..,))))).....|||.}}},,....,))))))))),,,..,.}}).))...,,.)))..)))))))))...)))))..............}}}}}...........{{,....|,(((.(((.((.((((((.(((...((...))..))).)))))).)))))...)))..,.})))).)))))))).....})),))))).))....))).)))))......(((((((..(((.(((.,...(((((.....((..((((((((.((.((((({{.,(((...{(.((((((....{,.......)}....))))))}},,.},)}}...,,...(((((((((((.....)))))))))))....{,((({...(((((...)))))}}})}}.{{{({{(.((,,((((.((..((((....)))).))))))))).))}))),.(((((..{.....}}.)))))...))))).)).))))))))..))))))).....))).)))...)))))))...........,...(((((....)))))....,|,..((((....))))..,,,.))))))))))))....{{((((((...))))))||,.{{{(((....))).....}}).))}.{||}}.,)))},.}},,}}.(((((((.{,,,{(.((({....})))}}((((.((((......)))).)))),{,.,.(((((((...((.......))(((((({((((.......))))..(((((((......))))))).((((.((((((((.((....)}...)))))))).))))(((((((((....{{......((((((.(((((..,....)..))))).)))))).........)).....))))},)))).||,|,,,,.|||)))}|{((({.((((((..(((..{(......((........)).,|||.,,...,,...,.......(((....(((({...)))))....))).....}}..)))..))))))..((.......))......}}})))|{|||,..,))))|(({......})}}....,..)))))))...))))))).))),}.,|{{||,|.(((((...)))))..((({({{{{(,{....((((......))))...))),.....)))))),)}))))).}.))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.