Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0005300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0082676 hsa_circHIPK2_007
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139299032-139416814 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139614286-139717015 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-541.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -580.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....(((((.(.((((..(((..(((......((((.....((..((((........))))..))))))....)))..)))....)))).).)))))..(((((..((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).))))..........((((...(((......))))))).....))))).))))))(((((((........)))).......((((((...((((((((.((((.......(((..((.........(((((((((((.((((.....))))............((((.((..((..((((..((((((((....((((.......)))).(((........)))))))))).....)..)))).))..))))))((((((.(.((........))))))))).............((.((((((((((.((((.((((............(((.(...........).))).......(((((((((((..((((((((((((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..(((((..(..(((((((((((...((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))((((((.((((((((((((.(((((((......))))..))))))).))))........((((.(((..(((((..(((.(((.((((((((..((((.((((((((.((....))...((((((.(((....(((.(((((...........)))))...(((((...........)))))((.((......))...)).....(((((((((((...)))))))))))...(((((...(((((((.(.(((.((((((.((...(((..(((..(...((((.(((((......((((((.(((.(((((......))))).)))(((((...((((((((((((((((((((.........((((((((((..........))))))))))..(((.((.((((...((((((((.......(((((.....)))))..))))))))....)))).)).)))((..((((((......))))))...))))))))))).)).........((((((((..((((.......))).)..))))))))......))))))))).)))))...(((((.((((......))))...))))).))))))..)))))..)))).)..)))..)))....))...)))))))))).)))).)))...)))))...)))..))))))))).)))))))).))))(((((((((...((.(((((....(((((((.......(((......)))..........(((((...))))).........)))))))....)))))))...)))....((.(((((((.....))))))).))..)))))))))))))).))).)))...)))))....).)).)))).......)))).))))))....))))).))))))..)..)))))...............))))))))).....)))........(((................))).(((......)))..........(((......)))........................)))))).))))))....)))).)))))))))).))((.((.((..((((....))))..)))))).......)))))))..))))........))..))).)))).)))))))).....)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((....{{(((.{.((((,,((,..{((,{,,..,.,.....,({..{{{{....,,,,))))..))))},....)}).,|}|,,,,,}}},)}))}))..(((((..((((.(.((((....((((.,.((....))....))))....)))).).))))..........((((.,.({{......))})))).....}))}}.))))))(((.,({,.{(((..,,))}}.,...((((((...((((((((.((((.......{((..((.{.......((({((((((({(({,{{((({,,.............|,|)}}}}.}|},|({(,,,{((((((({..{{,(,,.....}))).(((..{(......))}})},{{{{..,..{,{..,,.,.))},.||||||}}}||}}..},},}.,,}},},,......,|||..((.((((((((((.((((.((((.....,......(((.,...........).))).......{{((((((,....,,,...((((((((((...}))))))}}}...,|{{{....,,.....)))}.((((((...((((..((((((.((((((((,{(((((((...(((((....,(((((....,(,({((,,.,...,{,.,|||.|||.{..,{,..,,|,...}|}}}..{,.((((((.{((..{,((((((,,.(((((((,{{.((((.....))))}|||{,........))),)))))))...).}))))|{{(((((..,..,,,...}}}},}))}|||||.||}|}}}|||{,,,,.,||},.)),,)))})|||{....,,,{,,,.,,..,}))},,.{{{.(((,((((((((..((((.((((((((.((....))..,(((({{{(((....(((.(((((...........)))))...{((((...........))))){{.,,...,..},...,,.....(((((((((((...)))))))))))...(((((...(((((((.(.(((.((((((.((...(((..(((.,,...((((.(((((......((((((.{((.(((((......))))).))){((((...((((((((({{(((((((((.,,.{....((((((((((..........)))))))))),{(((.((.((((...{((((({|.......{{{{{...,,}}}}},,))))))}}....)))}.)).)))|}..{{(({(......)))}}}...}|||}}})))).}|,.,,.....((((((((..{(((.......))).)..))))))))..,,..))))))))).))))}...{((((.((((,....,))))...))))).)))))).,)))))..)))).,.,)))..)))....))...)))))))))).)))).)))...)))))...)))..)))))))))})))))))).))))(((((((((...((.(((((....(((((((.......{{{......,)}..........(((({...})))).........)))))))....)))))))...)))....((.(((((((.....))))))).))..)))))))))))))}.))),)}}...(((((...,(,{........}))),,)),,|.{{{{{.......,))))).},,}}}.}))))}.}}...........)))))))))))))))))}...,.,})})))))).......,{{{...,,(,,,,..,,}........},|||......}}}......)))).....))))))...)))))).))))))....)))).)))))))))).)){{.{{.{(..((((....))))..)})))).},,,..)))))))..))))..},....))..))),}))).)))))})),....)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.