Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0006800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0082678 hsa_circHIPK2_006
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139313699-139416814 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139628953-139717015 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-394.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -422.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 464.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....((((((((..(((..((.(((((..((((((..((((..(((.((..((((........))))..))))).......((((((..(...((((((((.((.(((((..((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).))))..........((((...(((......))))))).....)))))............(((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).((.....))...)))))).))))....)..)))))).(((((..........)).)))))))...)))))).(((((((....((((.......)))).(((........))))))))))...))))).))..)))((.((((((((((.(.((........)))))))))........)))).))((((((.((((.(((.(((............................))).)))((((.((((.(((((..(((((.(((((.(((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..((((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))....))))).))))).....)))))((((....((........(((((...........))))).......))...))))..)))).))))...((((.(((.........(((((((((((...))))))))))).(((((((..........))))).))((...........)).))).))))...))))))))))..((((((....)))))).......))))))))....(((.....))))(((((((((((((((((((....((((((((((..........))))))))))(((((.((.((((...((((((((.......(((((.....)))))..))))))))....)))).)).)))))..((((((......))))))...((((...))))............((((((((..((((.......))).)..))))))))....(((.........)))...........((((......))))..))))...)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((((..((((((.(((.........(((((((........{(,,((..((((........))))..)))}}....,|,(((({({{({..,,|||||.,{{{(((((..((((.(.((((....((((.,.((....))....))))....)))).).)))).,...,,...,,{|.|{(({......|||}|||..,..,|||,,{..........(((..((((({,{|...(((.({.....)}))).....,))))))..))).{{..{(({{,,{(({({{{||{{,,.,{{,||||||({,.,,,.........|{|}}}},.),)}}||(,{{(((((((({.,({,(,,.....}})).{{{..|{......)}|}}},||||,,}..,.,.....{,,||{,||||{|,|.{(|,..},}.}}}})))}},.,,....))),.)}||||||,|,(({(((.{(({......{{{,.{{(,,...........}}}.))|,,.....}}},})))}}).....})))}))}.))).))))))))))|||{...((((.........,.)))).,.}})}.|}}||||,,.{||||{{,,(((({{(((({....((((((((((.((((....,{({(.{{((((,{.(({,.{{{.{{{{{,.,((,.{.{{(..(((,({{{..||{{||..{|....,,,||,.}}||||,,|}||.|||,}}},.)))},||{{{........)))))}))))),,,),,}}})}||(((((..,..,,,...}}}}}})))}})}}.}}),)))||||,,,..,|}},.}),,)))}}|,|{,...||||,...,,..,})),..,}}..........)))).))).))))))}((.((((((((((.(({{(,...,,........(((((...........))))).......},...,,}},.((((((|({.{{{....{{..,{{.....,,|{{,,|||,.,,}}}}}))),)).})))))...,,,..,,.))))))).)))}},,)})})}}).,,},,})}.},,)}})))}),}}}||||,,,,,)))))}.......)))))))...))))))))))))))(((((((((((((((((((....((((((((((..........)))))))))){{(((,((,({((,..,{{{||||,,,,,,.{{{{{..,,,}}}}},,))||}}}}....})},.)).}|||,..{(((((......))))))...|||{,...,,|,,({.{{...({((((((((..{(((.......))).)..))))))))..}}....})}.....)))....,,,}}..((((,....,))))..))))...)))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.