Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0082679 hsa_circHIPK2_005
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139315911-139416814 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139631165-139717015 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-375.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -401.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 445.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((....(((((.(.((((..(((..(((......((((.....((..((((........))))..))))))....)))..)))....)))).).)))))..(((((..((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).))))..........((((...(((......))))))).....))))).))))))(((..(((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).((.....))..(((((((((.((....((((.(((((.(((..........((((.(((((((..((.((..(((((((((..((((.......)))).(((..((......)))))..((((....((.(.....).))...)))))))))))))..))))...(((((((.((((((((((.(((((((((((((((....((((..(((((((((((.............))).((.((((.((((.(((((..(((((.(((((.(((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..((((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))....))))).))))).....)))))((((....((........(((((...........))))).......))...))))..)))).)))).))...))))).........(((((((((((...)))))))))))((((((....(((((...((((.((((........(((...)))........)))).))))...))))).....)))))).........))).))))..))))).))))))))...))))))))))).).)))))))((((((((..........))))))))))))))).))))..........)))............((((((.....)))).)).............)))))))))((((((......))))))...)))))))).))).((.(((((.....))))).))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.....,.{(({,.{({{,,{{...,(({{{{....,,..,.,{{..{{{{....}},}))))..)))},.....{{((((.(((((....})))).,|.,{{{{,.,||||}||,,,{,.{(((((.((({,((.(((((.......(((((((((((((((..((((((...(((((..,,,,,,|||,{((,,,..,||{{{{.....,,,..(((..((((({,({...(((.((.....))))).....,))))))..))).{{..{((((((((((((((((((,,.{(({{((((((.,.............|,|}}}}}.),}}}(((.(((((((((({.,{{,(,,.....|})).{{(..{(......)),}}},||||}}}..,.,.....{,,||{,|{||{{,|.{(|,..,}}.}},})))}},.......)))}.)}||||||}|,((((((.{(((......{,,..{{({,...........}}).))},,.....}}},})))}}}.....}))))))..})}.))))))))))|||{...((((...........)))).,.}})}.|}}|||{,..|}||}(((((((((((((({....((((((((((.((((...,,{({(.(((({(,{.((({.{{{.{{{{{,.{((,.,,{{{..{(({(,,,..||{|||..||..,.,{{||{.}}||||{{|}||.|||{}},..)))},|{{{{........)))))}))))),,,),,}}}}}||(((((..,..,,,...}}}}}))))))))}.)}),)))},}|,,,,..||,,,)}.,)))}},,|{,...{{{|........,})),..,,}........,.)))).))).)))))))((.((((((((((.(({{(,...,,........(((((...........))))).......|,.....}},.((((({|({.{{{....{{..,{{.....,,{{{,,|||,.,,}}}}}))),)).})))))....,,..,,.))))))).))))),,),))))))...)))))).,..|,|)))})}})}||||,,..,})}}}},}}.....)})))),,.})))).))))))..))}}))))))........{{{..((((((((((..........)))))))))),}}(((((((.(((......))))))))))......))))))))))))))))).)))))}.....}||,|||,,.((((((......))))))...)))}}.,,))).,}}.))))).}((({{|,...}),))))
Forensic Context

No forensic context available.