Basic Information
Symbol
hsa_chr7_0188600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0125
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:139246531-139247070
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139561785-139562324
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-71.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-86.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
123.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((................)))))...(((..((((((((.(((...((((((((..(((((.((((((((((((((((((...)))))))))...........(((((((.......))))))).......(((((((........(((...))).........)).))))))))))((((..((((((.(((((......((((((((((...((.((((....((..((......(((.(((((.......(((((((...((.((((........)))).))))))))).............(((((.((((.........)))))))))..............))))))))......))...))....))))))..))))))))))..(((((....))))).............)))))...))))))..))))..........((((.(...(((((((..(...........)..)))))))).)))))))))))))....))))))))..))).))))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((................})))}...{{{.,{(((((((.(({...((((((((..{{{({.,{(((((..(((((((({...})))))))),,,,,,.....((((((({......)))))))...,,,}}|...,,........||..,.|},........,))}}}.{{{{{{,{(({..((((((.((({{......((((((((((...((.((((....((..((.,,...(((.(((((.......{((({,..{{((.((((........)))).))))))))},,,{,......,,|{{(({{(,,............}})))),.............))))))))...,}.}}.,.))....))))))..))))))))))..(((((....}}}}}..........,},)))}}.,,))))))..))),}}}}}}{{{.((((.{...(((((((..(...........)..)))))))}.)))).)))}))))....))))))))..})).)))))))))}.)))
Forensic Context
No forensic context available.