Basic Information

Symbol
hsa_chr7_0188800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0067
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:139247434-139248635 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139562688-139563889 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-360.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -384.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 330.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((...(((.((((..((((...))))...))))..)))...((((((.((.((((......)))).)).....((((((....)))))))))))).)).)((((..((((.(((((((....(((...(((.((((((......(((...)))..((((((((((........))))))))))(((..((((((((..(((((((((((......)))))..)).))))(((((((.(((..((((.((.(((....(((((........))))).......))).)).))))..))).)))))))..))))))))..))).((.((((...)))).)).........)))))))))....))).....))))))))))).....(((((((((..((((((.((((((...((....((((((((((..(((((((..(((((((((((.(.(((.((((((((..............((((((((((((.(......).))))..))...))))))...((((..(((..(((((.(((((....((((((((((((..(..........(((((((((((((((((((.((....)))))...((((((((....))))..))))..))))))).((((((..(((.(((.(((((.((((.(((.(..(((((((((......)))))))))..).).)).))).).).)))).)))))).)))))))))).))))).((((.........))))(((...))).)..)))))).)))))).....))))).))))))))..))))))))))))))).).)))).....................(((((.........)))))........(((((((...))))))).)))))........((((.((((.....)))))))).(((........)))......))..)))).)))........(((....((((((....((((((.((((((((((...(((.......)))..))))).)))).......).))))))......(((((....)))))..(((((((((.(.((....)).).)))))))))...........))))))...)))))))))))))((((...............))))...))...))))))...))))..))..)))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,,,({.((((,,(({(,,,|}||.,,}}}}..,}},||{||.||||||||||.....,)))}}))}}{{,((((((....))))))))}}}},}({{,.....((({{(((((((....(((...(((.{(((((..,...((,...|}}.,((((((((((........))))))))))|((,,{(((((((..(((,{{(((((......)))))..,)})}}|(((((((.(((..((((.((.(((....(((((........))))).......))).)).))))..))}.))))))),,)))))))),.})}.{(,((((...)))).)).....,,,,)))))))))....))}.....))))))))))),,,..(((((((((..((((((.((((({.,{(({.{{{{((((((((..(((((((..(((((((((((.(.(((.((((((((....,{,.,,,.,,|(({{({{((((.(......).))))..})}..}}}}}}...((((..(((..(((((.(((((....((((((((((((..{..,,......(((((((((((({(((({(.((,...||||}.,,((({((((....}}||,{||},..)))))}}.|{((((.,{{{.{{|,{{{|(|(|{(||({{|,,((((({{{(,,,,,.||||}}}||.,|....}}})).)}))}))),))}})).))))))|||}.,,,,,.|||{.......,.))))|||}}}),}.}..)))))).)))))).....))))).))))))))..))))))))))))))).).)))).....................,,,{{,....}},..,}}},.......{{|||||...,}}}}}}.))))).....,{{(((,.,,,...}}}))})|||..{((........))}..,,}.))..)))).)))........(((..,.((((((....{(((((.{(((((((((...{({.......})}..)))))}}))}......,}.)))))},,,...(((((....)))))..{((((((((.{,({....}}.}.}})})))))..,........)))))),..)))))))))))))})))).,....,,,....,}},|,,,|||..})))))...)))},.,}..)))))))))...,}})
Forensic Context

No forensic context available.