Basic Information

Symbol
hsa_chr7_0189200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0043
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
7:139251067-139251816 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139566321-139567070 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-250.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -264.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(.((((...((((....((.(((((.((((((((((.....((((..(((..(((((((..((((..((((((.(((((....(((.((...((((((....(((((((((((....((((.((....)).)).))......((((((....)))))))))))))))))((.((((((......)))))).)).............(((((((.....))))).))......((((...)))))))))))))))....)).))).)))))).)))).......((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((......(((((.......)))))((((((((..(((((((((((((((...((((......))))....))))))))).....))))))...(((...((((....))))))).........(((((.((((((((...(((((.....)))))....).)))))))...)))))))))))))....))))))))))))(((((....))))).....((((.(((((............))))).)))).)))))))))))))))))))))))))).))).))))(((((((.(((((((.....))))))))))))))..(((((((((((((......))))))..)))..)))).....((((....)))).........))))))))))...))))).))))))...)))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((.(.((((...((((....((.(((((.((((((((((.....((((..{((..(((((((..((((,,((((({.(((((...,(({.(({..,((((({{,,{{(((((((((..,{..,,.||....}}.}}.}}......{(((((....)))))})))))))))))}|.((((((......))))))..{{{,...,}}}...{{(((((.....))))).)}......,{||,,,})))))))})))))}..,,)).))).)))))||}}|||,,....{(,{{..{.((((((((({,({((,.(((.(((((((((......(((((.......)))))((((((((..(((((({((((((((...((((......))))....))))}}}})}}}}.)))))},,.(((...((((....))))))}.,,,.....{((((.((((((({...(((({.....})))}....}.)))))))...)))},))))))))....)))))))))))){(({|..,,)))))..,,,((((.(((((,,.,,.....}.))))),)))).))})))))))))))),)))))))))).,)),))))(((((((.(((((((.....))))))))))))))..{((((((((((((......))))),.,)))..)))|{{...((((....))))....}},..))))))))))...))))).))))))...)))).)))}...
Forensic Context

No forensic context available.