Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0029400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0135914 hsa_circPTK2_055 hsa-PTK2_0067
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141799573-141856777 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140789474-140846678 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-167.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -183.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 242.4
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((...((..((((.((((((((...(((......(((.(((.......(((((((.(((..(((((((((....)).)))))))..)))(.((((((.((((.(.((((.((((.......))))(((.(((((((((.(((((((.((((.......)))).)))))))(((((.((((..((((((...((..((........))..)).....))))))..)))).))))).............((((...(((((...((....))....)))))))))..(((...((.((((....)))).))..)))))))))))))))..(((((((((((..((((((....)))))).)))).(((.....))).......(((.........)))......))))))))))).)))).).)))))).)...(((((((..(((((..........))))).....))))))).))))).)).........(((((..........)))))))).)))...)))))))))))))))..))....)))((.((....(((((((....(((.((((((.....))))).).)))(((((((((((((..........))))...))))))).))..........(((.(((.((..(((....)))..))...))).)))....((.....))..(((.((......)).))).))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,....,{{..,,...,(((((.(.(((((((({...((((((((((.{{(((((({.(((..((((((({{....}}.)))))))..)))....,.,,|||||}},}((((({({.......||}}(((.{{{{{{{{|.{{{{(((.((((,,.....)))),))))))}(((((.((((..((((((,..((..((........}}..}}.....))))))..)))).))))).....,,,,,...(((,..{{{{{(,,.{{..,,}|....}}}|}}|||,,{(({{,,,.{{{{..,,))}}.}}},})))))))))))))}}}}})))))||||,.((((((....)))))).,,,|||||,....)})}}}......},})))))))})))))|{....|||,|{{{.,{|,...,.{{{|.{{{.(((((((..{{(({..........))}}}.....))))))).},,),,.,,....}},.{((({..........))))}}})})})}}..)))}(((((({.((((((....((((...((.{(((...{....((((((((.,....{{{||||{..(((,(((((((({(({..,......})},)}}}))))))){((({.....}.})))...}.)))..}}))}})..,......)))))))}...,}.....))))))...}.))}.....)))))).}},))))))
Forensic Context

No forensic context available.