Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0001400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0053
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:139257697-139305309 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139572951-139620563 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-622.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -654.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 515.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((((((...)))))))(((.(((((((((((((((............(((((((((....((((..............(((....)))(((....(((((((.........)))..................((((..(.(((((..((....(((...((((.((.(((.(((............(((((.......(((......)))........................(((......))).....)))))))).)))...)).))))...)))..))..))))))..))))........))))..)))(((........)))...))))))))))))).....)))))).......))))))))).))).........).)))(((((.....(((((((..((((.......))))..))).)))).........((.((((((.........(((((.(((((((((((.....)))))))))))....(.((((...(((((...))))))))).)..(((((..(((.((((((((.(((........))).))))).)))..)))..))))).......((((..(((.((((........(((((.((((((((.......((((.((((((((...................(((((....)))))....((((.(((..(((.((.(((((.((......))........((((((...))))))(((.((((((....))).....))).)))........))))).))..)))..))).))))))))))))..))))(((((((((.((((......)))).))))......(((((((...((.......))(((((((((((.......))))..(((((((......))))))).((((.((((((((.((....))...)))))))).))))(((((((((....((......((((((.(((((..(....)..))))).)))))).........)).....))))).)))).((((........))))((((((.((((((..(((..((......((........))..(((......)))..........(((....(((((...)))))....))).....))..)))..))))))..((.......))......))))))(((((...)))))((((......)))).......)))))))...))))))).)))))..........(((((...))))).((((......(((....((((......))))...)))......)))).((((((((....((((((........))))))))).))))).............))).))))).)))))...((((((.(.....).)))))).....(((((((((.....))))..)).))).(((((.((((.(((.(((............(((((.(((((........((((((((((((....)))........(((((((((..((((((.......((((.....))))......)))))).....))...)).)))))..........(((((...(((........)))..)))))........))))))).))..))))).)))))...........))).))).................))))))))).((((.((((((.....))).))).)))).((((((((((...((..(((((((((((......)))))))..............)))).))...).)))))))))....(((.((((((((....((((.(((..((((.............)))).))).)))).)))))...))).))).............(((...)))..)))))))..))))....))))).....)))))).))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,....(((((((...)))))))((({(((((((((((((((.{..........(((((((({...,((((.............,,{.{.,(({({{.....,|||||,,.......,}.....,..............((((..{.(((((..((....(((...((((.((.,,,{,(({{{{.......,(((((.......(({......,}}........................(((......))).....)))))),)})))}..)).))))...)))..))..)))))}..))))...,..,|}}}}.|||},||..,,}.....},..))))))))))))),,.,.)))))).......))))))))).,))}}.......}.)))(((((..,,.(((((((.,(({{.......))}).,))).)))}..,,.....((.((((((..{{{{{{{.(((..(((((((((((.....)))))))))))....{,((({...(((((...)))))}}})|||{{,{|{|.(({,((((,((,.((((....)))).)})))))}),},.|||{.|{{{{..,....,||,},|||.,|||..,,,{,.|||||.||}}|||||}......{((((((((((..,,,,,.............(((((....)))))....|{{,.((({.,,,}||},,{{,.({,{,...||.......{(((((({{{|,,,,,({{..(((((.{{{|||{....||.............|||||{||,.|,|{{,,|,|,,,.}}|,((({....))))}},,,{.(((({{{.{{|||,.{(,((.{{{.(((......}))}},....)).))...}))))...))}))))..,,||(.(((((((((,..,({,{,,,(((((((.((.{.{((((....,(((((((((((...,,,|}}.},.,}.)))).{(((({.(((((,{(,,,.}..,||||.}}}}}),,.(((((((.....(((((.,,({,.,........{{.||}}{{{(((,{(((((,,(((..,{...,,.((...,,,,.||,.{{{,{{,,.{{...........(((....(((({...)))))....))).....,,..}}}..})}}}),.((.......|}......}}})})..}}.},{|||||((((......))))....((((((....)))))){{||{||||||.....||,.(((((...))))).,,{{...{{{(,,....((((......))))...)))}.,...))))}|{(|({({....((((((........))))))})}..}})).},},,,,.,..}}||..|,.{{,,.,....((((((.{.....}.))))))......|||}|{{|...||}||}.....,,..,{(((.{{.{{.||,||{........})).)}.||.}},|||........,...}}}))))).,)}))}}......,}|)))))..)))))))..}}}}},|||.}}}}))),.....,)}..))}}})))).)})))).}.}}}},,}}}}.(((((...(((........)))..)))))....}}...))))))).)))))}}}}||||},....,,,,....},)),,))),.}})))}},}})))),||,||,||||..}))))...},))),}})))))..((((((((({...((..(((((((((((......)))))))..............)))).))...).)))))))))..)))))))))|((((....((((.,,|,,|,,|,,...........})}}.,,|{||||{|,,,....,},...,.||||........{||...,}}..))}},,,..))))...})))))}}...)))))).)}))),})
Forensic Context

No forensic context available.