Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0007900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0172
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:139415337-139416814 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139715538-139717015 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-446.14 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -474.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((......((((...((((((((.........((....(((.((..((((........))))..)))))....))....(((((((.(((((....((((((((.((((((..(((......)))...)))).........(((((((.((.((........(((((((....(((.(((((((......(((((((......(((((..((.(((((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).(((..(((((((((((((.((((((..(((...((.(((.((((((.(((..(((......))).((((.(((((((((((..((((.......)))).(((..((......)))))..((((....((.(.....).))...))))))))))))).(((((((((((((................((((((.((((...................................)))).))))))..((((((((((..(((((.(((((.(((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..((((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))....))))).))))).....)))))(((((.(((..........))).)))))..))))).................))))))..)))))))...................(((((((((((...))))))))))).....))))))......))).)))))).))).))((((((.(((......))).)))))).))).))))....)).)))))))).)))))..)))...(((((((...........)))))))....(((((((((((((((((........))))).....)))))).....))))))..((((((((((.(..((((..(((((.((((...))))))))))))).))))).))))))(((((..((((((......)).)))).....)))))...)).))..)))))...))))))).))))))).((((......)))).((((((((....))).)))))...)))..))))))).)).)).)))))))..........)))).))))))..))))).)))))))...))))).)))...).)))......)))))..))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((......(({(...((,(((((.........,{....{{,{((..((((........))))..)))}}....,}.,..(((((((.(((((....(((((({(.((((((..(((......)))...)))).,.{,....(((((((.((.((........(((((((....(((.((((({(,.....(((((((......(((((..(,.{{(((..((((({,(,...(((.((.....)))))...,.,))))))..|}}.((,.,(({{{((((((((,{{((({..(({,{{((,({{.{{{{,,.,,...{{||||,,.),}|||{{,{{(((((((({.,{{,(,.....,,|}}.(((..{{......))}}}|,{|||,,|..{.{.....|.|||..||||||}|,||||{,|,{{|||{||},.,|,,....}}}..||||||{,.{,{,,|||.,|||,.....,|{,.,{({{.,{..,.....|||,|||{{{..,,|||,|||}|,|,....|||||||||||||},})))}|))||||,.,||{{..,,,,...|,))}),,.|||,.||{((((.((({{.(((,.((((..(((((...,(((((((({(.((((..,.,{({(.{{((((,{.(({,.{{{.|{{,{..,(({.{.(((..(((,({{{..||{{|{..{|....,,,||,.}}||||,,|}}|.|||,}}},.)))|,|||{{........)))))})))))},,),.}}})}|}|||||..|..|||,..},|||||}}|||||,||},||||{|,,,...,}}},.}),,)))}}}}|,....||||,...,,,,,})),,,,}}..........)))).)}}.))))))},,.,))))).)))),||||...}}}....}},,|||{|...,,,.,,,,)}}}},......|.....,}}},|||||||({,{,,....||...||.....{{{{{{{{{{{...))))))))})).}}}|||..,}}},}}..})}))}}}},}}}.}}{{|{||.|||......,}}.}))))).},}.}}}|....))})))})))),)))))..}}|...(((((((,,.....,...)))))))....{,{(((({(((.(,(((....,,,.),))),}}}},,))},}},,.,}}},|,{((((((((((.{..{(({..(((((.((({...})))))))),))).})))).)))))))|,,}},|{{{||,..,,,}},)))),..))))}})}}))).))..)))))...))))))).))))))).((((......)))).((((((((....))).)))))...))).}))))))).)).)).)))))))}}........))}).))))))..))))).)))))))...))))).}),..,},))}......)))))..)){...}
Forensic Context

No forensic context available.