Basic Information
Symbol
hsa_HIPK2_0008000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0048
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
7:139415434-139415912
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139715635-139716113
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-142.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-150.83 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
142.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.(((((....((........(((((...........))))).......))...))))).((((((.((.(((....((..(((............)))..)).....))).)).))))))...........))))))).)))..))((...((((.(((((........(((...)))((((.((.((((.....(((.((((((((((..(((((((...........)))))))....(((((((((((((((((........))))).....)))))).....)))))).(((((((((((.(..((((..(((((.((((...))))))))))))).))))).)))))))......((((((......)).))))...))))))))))))).......)))).))))))))))).))))((((......)))).((((((((....))).)))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{((({(((({,((,{(....,,......,,(((((...,,,,,,,,||}}}.......|......,,..{|{{||{({,{,,....{{..,,,.....{{{{{,{|||,.,,}}}}})))})).|}}|||...,,,..,..)))))}).))},,,}{(.,,((((.(((((........(({...}))((((.((.((((.{...{((,((((((((((..(((((((,,.....,...)))))))...,{,,((((((((.(,(((....,,,.).)))})))).,))},||,|..}}},|{{((((((((((.{..{({{..(((((.((({...})))))))),))).})))).))))))),.,},.((({{(......)).))))...))))))))))))).....|.)))).))))))))))).)))}{{{(......)))}.((((((((....))).))))).....,))
Forensic Context
No forensic context available.