Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0016
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:139415536-139416814 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139715737-139717015 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-364.24 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -389.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((.....(((((((....((.(((((((.......((....(((.((..((((........))))..)))))....))..((.(((....))).))(((((((((((...((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).))))..........((((...(((......)))))))......................(((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).(((..(((((((((((((.((((((..(((...((.(((.((((((.(((..(((......))).((((.(((((((((((..((((.......)))).(((..((......)))))..((((....((.(.....).))...))))))))))))).(((((((((((((................((((((.((((...................................)))).))))))..((((((((((..(((((.(((((.(((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..((((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))....))))).))))).....)))))(((((.(((..........))).)))))..))))).................))))))..)))))))...................(((((((((((...))))))))))).....))))))......))).)))))).))).))((((((.(((......))).)))))).))).))))....)).)))))))).)))))..)))...(((((((...........))))))))))))))).)))))))))).))...)))))))...))...)(((.((((..((..(((.(((((((((.(..((((..(((((.((((...))))))))))))).))))).)))))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..({.....(((((((....({.(((((((.{{....{{....((,{((..((((........))))..))))}....,}.,{{.,(({{{.,,,}))||.(((((((({..((((.(.((((....((((.,.((....))....))))....)))).).)))).,........((((...({{......))}))))...........,..........(((..((((({,(,...(((.((.....)))))...,.,))))))..))).(((..(((((((((((((.((((((..(({,,,((.(({.(((({{.{{{..{({{,,.,,|}|,|,||,{||(((((({{.{((,{,....,,,|||,(({,,{{,,....}}},||,{||||,|..{.,..,,,{.|||..|,||,{|{.(((((((.((((((((,,..,,.....,{...({(((((....,,.}}}.}})).......,,..{{(,,{{{.........||.}|||||....|,}.}||},.||....|,,}}}}}}}}}}).)))).,)))))}}.}||,|....,,,..}}))}),},||}}.|||{|||.{{(((,(({..((((..(((((....(((((((({(.((((..,.,{({(.{{((((,{.(({,.{{{.|{{,{..,(({.{.(((..(((,({{{..||{{|{..{|....,,,||,.}}||||,,|}}|.|||,}}},.)))},|||{{........)))))})))))},,),.}}})}|}|||||..|..||,,..}}||||}}}|||||,||},}|||||,,,...,}}},.}),,)))}}}}|,....||||,...,,..,})),,,,}}..........)))).)}).))))))},,.,))))).))))|{|||...,|}....,,.,|||{|.......,,,,)}}}}.......},...,}))},|{{||||||,{{,....{{..,,{.....{{{{{{{|||,.,,}}}}})))})).}}}})}.,}}}},,,.})),)))))),))).)){{||||.|||,,,.,,,}}.}})))).}}}.))}}....)),)))))))).)))))..)))...(((((((...........))))))),,}))))}.)),))))))).,)...)))))))...},,..)(((.((((..{{..(({{(((((((((.{..{(({..(((((.((({...})))))))),))).})))).))))))))}))))).)))
Forensic Context

No forensic context available.