Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0009100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0118
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:139415731-139417234 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139715932-139717435 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-453.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -481.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 387.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.......)))))..(.(((((.(.(((((....(((((.(((..(((((((((..(((..((((((((((.((((((.(((.((((.((.((((((((((((....(((((...(((..(((..((........))..))).)))....))))).))).)))))..)))).))))))..))).))))))((((.....((((((((.(((((.((((((((((....)))))))........(((((((..((((((((..(((((((((((.....))))))).))))(((((((...((((((((......(((((..(((....)))))))).......(((((((........(((...((((((((....((((..((.((((((((...................))))))))))..))))..))))))))...)))........))))))).(((.((..((((........))))..))))).........((.(((((....))))).))..(((((..((((.(.((((....((((...((....))....))))....)))).).))))..........((((...(((......))))))).....)))))...........(((........))))))))))))))))))..))))))))..)))))))....((..(((....((((((((..(((...((((.....))))............(((......))).((.((..(((((((((..((((.......)))).(((..((......)))))..((((....((.(.....).))...)))))))))))))..))))))).)))..)))))...)))..)))))))))))))))))).))))......)))))))........)))..))).)))))..(((((...((.(((.....((((((.((((((((((((.((..(.....)..)).)))))..((((((...((...(((((((.(((...((((.((((..(((((....((((((((((.((((...((((...((((((((.(((......))).....(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..(((((........)))))..)).)))))).((((((((((((..((((((........))))..))..).))))))).(((((..((...))..))))).))))...((((........))))...........)))).)))).))).)))))))....))))).)))).))))...)))....))))))).....))......))))))..............)))))))((((.((......))...))))...(((((((((((...))))))))))).))))))...))).))...))))).)))).))).)))))...))))).)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,.,,,,.}||||,.({(({{{((,(((((..,,,{({(,(((..{(({({(((..((({{{,,(((((({.((((((.(((.(((,,((.((((((((((((....,((((...{,,..(((..({........)}..))).,,}....))))}.)))},))))..)))).))))))..))).))))))((((.....(((((((,{(((((.((((((((((....)))))))........(((((((..((((((({..(((((((((((.....)))))))},))}(((((((...((((((((......(((({.{(((....)))))))}.......(((((((.....,..(((...((((((((....((((..((.{(((((((...................))))))))))..))))..))))))))...)))........))))))).{{,{((..((((........))))..)))}}.....,.{,{{.(((((....))))).}|.|{((((..((((.(.((((....((((.,.((....))....))))....)))).).))))..........{{((.,,(({......))))))).....}}}},.},........{{{,,.,....)}})))))))))))))))..))))))))..)))))))....((..(((....((((((((..(((..,(({{(((({(,,.............|,|}}}},.),)}}{,({,.(((((((((..{{,(,,.....}))).(((..((......))}}),.((((....,(,{.....,.))}..))))))))))))),.}},.))).)))..)))))...)))..)))))))))))))))))).))))......))))))),.,,.,,......,}).)))}},.,((((.,{((,({(,,,,.((((({{((((((,,,|||}||}{({{...|{{|,.,,,,...,,||||...|||,.{((((((.((({{.(({,.((((..(((((,..{((((((((,(,((((.,,.,{({(.{{((((.{.((,..,{{.|||.{...(({.{.(((..(((.((((..((((((..{{.......}}..))))))..)))).))|.}}},.)))|,||||{,,......))))},)))))}.,)..}},))})|||||..}.,}}}}..,,|||||}}|||||,||,{||||{|,.....}})},.})}})))})}}},....}}}}}...}}},.,)).}}}))..........))))}),,.}))))),}}},)}}}}.))))}|}}}...}}}....}}}}|||{|....,......)))))}......,......})}}))))||||,{{......},...}}},...(((((((((((...))))))))})),)))))),..))),})..})))}||||}}.}}}.}}}}},..))}}}.}},,)))}.
Forensic Context

No forensic context available.