Basic Information

Symbol
hsa_HIPK2_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK2_0137
Host gene
HIPK2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:139439841-139442477 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:139740042-139742678 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-799.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -851.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 630.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((.(((.(((((((...((((....(((....)))......))))..............((((((.......((((........))))(((((....)))))..........(((((((...((((..........((.(((((((..((((((((((.((.((((((((..(((................)))...(((.(((((((((..(((((....)).)))..))))))))).))).((..(((((((...((((((((.(((((((((((.......)))).))))........))).))))))))....)))))))..)))))))))).)).))))))))))..))))))).))......))))((((((((((.(((((((((((..((((...((((......))))...((((....))))........(((..(((........))))))...))))..)))...)))))))).......(((((((...(((((.(((((.((((((..(((((((((((((((...((((((((...)))))))).......((((.((((((((((....)))..)))))))))))....))))))...)))))).)))((((.((((.....)))).))))..(((((..(((((((((((..(........((((.....))))...((..(((((........))))).)).......)..)))))))))))(((....)))..(((((((((.(((.................))).)))))))))..((((((((.(.((((.((((........(((.....)))(((((..(((((((.......((..(((((.((((............))))))))).))))))))).)))))......)))).)))).).))))))))((((.((((((.(((.......))).))))))...)))).)))))....(((((........)))))..)))))).))))).))))).)))))))..)))).)))))))))))))))))))..)))))))...))).)))))..(((((((.......((((...........)))))))))))....(((((((.(((........((((((((((.((...(((..........(((....((((.(((((((..........))))))).)))).....))).)))...))))))....((((((((...))))))))(((((.((((....(((((...((((..((((((((.(((((((((((..(((((((((((.(.......(((((...)))))........).)))))..........((((...........((.((((((((((.(((..(((..(((((.......((.(((((((.......((((.((((((........)))))).))))....((((((((((...........((((((((((.((.......((.(((((....((((...))))...((((((...)))))).((((((.((((((((((((.(.(((((((.(((((((.((((.(((....)))))))...((((.....))))(((((....)))))((((((((......(((....)))......)))))))).............)))).))).))))))).).)))).(((((((((((((((((((..........)))))..........((((((((((.....)).))))))))....(((....))))))).))))))))))....)))))))).))))))........))))).)).(((((((.........)))))))......)).))))))).)))..........((..((((......))))..))))))))).))).))))))))))))))..))))))..)))))))))).)).(((((..((((...(((((......)))))......))).)..)))))))))..))))))...))))))).)))).))).)))))..))))......))))).....)))))))))..(((((((.......((((((((...))).))))).....)))))))))))))))).))))).))((((...((((((((((((((((.((((((.(((.((....)).))))))))).)))).(((.(((((((((..(((...((((.(((.(((((.......)))))))).)))).....(((((((((.(((.((..(..(((...)))..)..)).)))..))))))))))))))))))))))))........((((((.((((..((((.((((.........))))))))................(((.((.(((((((............)).))))).)).))).(((((...)))))..(.((((((((.(....(((....)))..).)))))))).))))).))))))..)))).))))))))))))....(((((((.....))))))).....)((((.....((.(((((((((......((((...((.....))....))))))))))))).))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...(({((.(({.(((((((...{(((,,..(((....)))..}...})))....,.........(((({{,......,,...,{.,...,|||({{{{..,,}}}||,,,,......{((((((...((({........|.({.(((((((..((((((((({.{{,((((((({..,{,...||,,,,,......{((((((((.(((((((((..(((((....)).)))..))))))))).)))........}))))}.((((((((.((((({{{(((.,,....}}}}.}))}........))).)))))))}...,))}},})}}}},,}}}))},)),))))))))))..))))))).}}.|||..})))((((((((((.{((((((((((..((((.{,({{{..,}}.),}}...{{((,,,,}}}}.......,({{..|||.......,,}}))),..))))..)))...)))))))}.......(((((((...(((((.(((({.((((((..{((((((((({((((...{{{{({{{.,,|||||}}}....,,.((((.((((((((((....))),.})))))))))).}},))))))..,)))))).))}{(((.((((,...})))).)))}..(((((.,(((((((((((..{,....,..((((.....)))),,,,{,,{({{{....,}}.))))).,,......,,..))))))))))}(((....)))..(((((((((.(((.,{...........,,.))).))))))))),,((((((((.{.((((.((((..(((((((..,...{((((((..,,((((.,{{,.......,,|.|||.,,,,...........,)))},,)))))))...}..))).))))....)))).)))).}.))))))))||{,.((((((.(((.......))).))))))...}}}),)))))...,(((((........))))).,)))))).})))).))))).)))))))..)))).)))))))))))))))))))..))))))).,,|}|,|||||..(((((((.......((((...........))))))))))),,,,((,.{(((({,((.(.{{,((({{{((,(.((,..,,,,{,,......|{||,,.{(((.(((((((,,.....,,.))))))).)))}..,,,}},.}))}}.)))}}}..,}||||{|{|,..)))))},,((((,{((((..{.(((((...((((..((((((((.(((((((((((..(((((({((((.,.....{,(((((...})})},..|.,..|.}}}||..........,{{{,|,|,...,.,((.((((((((((.(((..(((..(((((.......((.((((((((({{...((((.((((((........)))))).))))....,,,,{{{{{,........,,.,,{(((((((.{,......)))}},}}.....{{,{...}},,...,{{{{{...|}}|}}.((((((,((((((((((((.(,,,,,,,,}|||||||}|{{(|({(|,,.}})))}|...((((.....))))(((((....))))){(((((({({(...(((....)))....|})))})))}.............,})).))}})))))},.|,}}||.{((((((((({(((({{(,......},,,}}}}|,,....,,..((((((((((.....)).))))))))....||{....)))})}).))))))))}}....,,}}}}},.||||||.........)))}.)).(((((((......,..)))))))...,}),)}))))))).)))}},.......{(..((((......))))..))}))))))))).}})))))))))))))..))))))..)))))))))).)).{((({..{{{{{|.{{{{{......)))))......})).),,)))))))),..))))))...))))))).)))).)))}}))))..))))......))))).}.,.)))))))))..{((((((.......((((((((...))).))))).....))))))))))))).))})}},}.|{((({..,((((((((((((((((.((((((.(((.((....)).))))))))).)))).(((.(((((((((..{{(...((((.(((.(((((.......}))))))).)))).....(((((((((.(({.({,,(....{|,,..},.,..)).)))..)))))))))}})))))))))))))........((((((.((((..({{({({{{.,...,,.})},,)))).,,..,,,..,..,..(((.{(,((((({{............}).))))}.)),))).|||||...)))))..(.((((((((,(.||,{{{..}},}}.,).)))))))).))))}.))))))..)))).)))))))))))).}}.((((((||....})))))),}...}((((.....{(.(((((((((......{(((...{{.....))....))))))))))))).)}....,.))))
Forensic Context

No forensic context available.