Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0009500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0080
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:107599178-107599708 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104836897-104837427 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-199.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -209.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.