Basic Information
Symbol
hsa_HIPK3_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0021596
hsa_circHIPK3_008
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33307959-33361080
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33286413-33339534
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-416.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-449.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
558.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((((......((((......)))).............(((((((..((((((((((.(((........))))))).((((((..((((.((((.(......((((((......(((.(((..((((.(((((((((.....((((((((..((.(((((.......)))))))...))))))))......)))))))))))))..).)).))).....)))))).....).)))).))))...)))))).......(((.((.(((((.........))))).)))))((((...........))))))))))....)))))))((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..))))....))))))((((((((((((((.(((((........).))))..))).)))))))).)))((((...((((((.....))))))))))..(((((((((((((.((.......((...)).......)).))))))..)))))))...((.((((.((.((.((((...((((.(((.....))).)))).....)))).))))))))))(((((..((((((((((.....)))))))))).))))).))))(((....((((((....(((((.((((....((....((((..(((.(((((((((((.((((..(((.(.((...(((.(.(((((...........))))).).)))....((((((.................((((........))))))))))......(((....(.(((((((((((((((((..(((..(((((.....((((((...............((((((........))))))((((....((((.(((........)))))))....))))...........))))))..)))))..)))..))..))))))(.((((((..((((((.......((((((((..((...))..))))))))...))))))..)))))).)(((((((..(((......((((((((((((.........((((((((((((((((((.((((((((........)))))))).....((((((....))))))..)))))).)))))))).)))).((((((((..(((((((((..(((((((((.....)))))((.((((.((((((......))).))))))).))......))))..)))))).(((....)))...(((((((.....))))))).)))..))))))))...)))))))).))))))).)))))))))))))))).)...)))..)).).))))))))))).))).))))..)))..))))....))...)))).)))))..((((((((.(((((....(((((.((((.((.(((((.((.((.....(((..(((.((((((.....)))))).))).((((((((...(((((((.......................)))))))...))))).)))..))).....)).)).)))))))..)))).)))))..))))).)))))))))))))).......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,{(,(((({{,...((((..,{{,}|,|,,,{,,...,...(((((({.,(((((,.{(((((((({{,.,,,({{......}||{,,{{{{(((((((..{(,.(((.{{...,,.||}..||..((((.(((((((((.....((((((((..{,,(((((.......})))},).}.))))))))......))))))))))))).}},,}}}})))))))}||{{{,,{{{{|{,..|{|||||||{{}|,.,,}},(((.((.(((((.........))))).)))))||||,||..{|....,}))}}))}|,{,,}}}}}}}((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..))))..,,}))))){({(((((((((((.(((({{{...,,.}.))))..))),,))))))).})|{(((.,.{(((((.....)))))))))},.(((((((((((((.((.......{{...)).......)).))))))..)))))))..,{{.((((,{{,{{.{{{|.|{((((,,{,.,,,}))).,}}}.....,}}}.,}|}}|}|||(((((..{{{|||||||,....)))))))})),}}}}}.}}))(((...,((((((....((({{.((({....{{....{{||,.{{{.{{{{|||||||.{(({(((((((((...{((...((.(((((.(({{,..,,,,,.,,.}}},..})))).))...))}.)))))).)))|||,,.,,..,}}||||||||.|,|||.,{{((,.{{{,|||,{|||,}.}}}}})}},.|||||.}}}}||||{,|}},...........{{{{|{,......,||}}},{{{{....(({{{{{{........)))))))....)))),,.....,,,,,.,}}}|}}}))}...{({{((((((({{.{{((((((..(({((({{({{{.((((((((..((...))..)))))))),,,||}}}}.}))))))}))}))}}}.}}}},}},..{||||||||{|||.,||||{|||||{{{{{{|||||,|.,}|,,||,|}}},,,,,}}}))}},}}}}.||||||,.||||||....}|||||||||}|||}}}||||{({{{{||,,||{||||{|,}||||||(((..,..}||||{({{(((,{((({{......}}}.}}},})))},,}}}}})))),.}}})))}|,,....}},...(((((((.....))))))).,,|..}||}}}},.},}})))}}},))}}..,}))))}}.))))}}.......,,,,...,|}||||||}}}|||,}}}..}}}.,)))..}}}}....||,,.}}}}.)))),..{(((((((.(((((....(((((.{(((.((.(((((.(({((..{,.,{,..{(({((((((,....}}||||,|||.{{{{{|||,}}||(((({...,,.,,,,.,,{{...,,...))))))),..,}}}}.)))}}})),,,.,)),))})))))})..)))}.)))))..))))).))))))))}})))).,.,,..)))
Forensic Context
No forensic context available.