Basic Information

Symbol
hsa_PTK2_0033800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0085762 hsa_circPTK2_036 hsa-PTK2_0071
Host gene
PTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:141810558-141889736 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:140800459-140879637 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-221.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -241.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((..((((....((((((((.....(((........((((((...(((((.(((((.((..(((((((..(..((((((((((((.((((((((.((((((.(((....((((..((((.(((((((((....)))).))).)))).))..))))((((((((((((((...)))))).))))).)))..............)))))))))))).....)))))....))))))))))))..)..))))))).))))(((((...((((....))))))))).((((((((((((((((((((((((((..(((((((((....)).)))))))..))).......(((......)))(((((........(((((((....)))..))))........)))))))))))))))...)))))..).)))))))))).)))))..))))))....)))......)))).)))).......((((((..((((......((....))......))))..))))))((((((((.((..((((.........))))..))..)))))))).)))).))))))))((((((((..((((((....)))))).)))))((((....(((((.....(((..(((((((((....))....(((.((((.(((......((((..((.(((((((..(((((..........))))).....))))))).)))))).......))).(((((..........)))))..)))))))....(((((.(((((..((.......))....))))))))))....))))))))))......)))))..))))(((((((((((((..........))))...))))))).)).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.,{,{((,,,.,,{,((((...((((({..,....,|.}}}}|||||||||{|{{{{{|{{{{.{((({{{{,.{{{{{,{(||{{{(,{({,(((((({(((((((,{(((((((((((((((((({(((((....}}}),))).)||,(({.....,))),,{{(((((((...})))))}.}}||(((....{.{(((((,...(((....))).{(((((.(((((((((((,{(((({.,((..,.,,|||,,|((,{((....,,,...,,}.})),.)),.,},},..}}}}))}},,})))))))))).)))))))))))}.})))},)))))))})))))))).{{,...((((((.((...((((((..,((,...,,,..}}}...((((((((((.,,..((({,{(({{((({{((.(({{{{(((((({{.((..((,{......||..|,....,|}}},,..},,,.})))).....{((((,..(({....}}},,,.,((((({((,,,,{{{(((({((,.(((,...,}}}},,)))}.},,,},,)))))}}))||||.,,}}})))|((((..((((((....)))))).)))))))))}..}}}}..},.}}}))))))}}}..|||...,},.,))})))..,,..))).)))))))...))))))..)).))))))..))...}.}))))),..,.)))))).}..,,,,......|},,|{|{,..........))))}}})}}}}},..,)})))|,|,|))),|}}....||||....,.,,),))},.....(((.{(((((.....))))).}.)))(((((((({{{{{,,,......})},}}},))))))).))...,...)
Forensic Context

No forensic context available.