Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0016
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33308009-33309057 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33286463-33287511 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-269.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -289.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((..((((((((((((.((((..........(((((((((((((((..(((.(((.((...)).)))..))).((((.(((((((((.....((((((((..((.(((((.......)))))))...))))))))......))))))))))))).((....))))))))))((((((.((((((..(((((((((((((((......(((.((.(((((.........))))).))))).....((..((......))..)).(((((.......((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..)))).....)))))((((((((((((((.(((((........).))))..))).)))))))).)))((((...((((((.....))))))))))..(((.(((..(((((...)))))..))).))))))))))).........((((......))))((((.....)))))))))))...)))...)))...))))))............((((((((((.....)))))))).)))))))))((((((((((..((((((((((((((((....(((..((....(((........)))...)))))))))))))..((.(((((((((...(((...((.(((((.((((............))))..))))).))...))).)))))).))).))..........))))))))...))))..))))))...(((((((((.(((((((((..(((((.....((((((...............((((((........))))))((((....((((.(((........)))))))....))))...........))))))..)))))..)))..((((((......((((((..((((((.......((((((((..((...))..))))))))...))))))..))))))))))))))).)))...))))))))))))).))).)))...))))))....))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((..((((((((((((.((((.,......{{((((((({(((((((.,((,,(({.{{...}}.}}}..||,.((((.(((((((((.....((((((((..{,,(((((.......})))},).}.))))))))......))))))))))))).}},.}}},)))))))|(((((.{((((,,..{(((((((((({,,..,,,},(((.((.(((((.........})))).)))))||}},||..{{....,|||,{|}.(((((..,{...((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..))))..,,.))))){({(((((((((((.(((({{{...,,.}.))))..))),,))))))).})|{|||,,,{{{{{|,....)))}})))}}..(((((((((((((.((.......{{...)).......)).))))))..))))))}..{{{.((((({{{{.,|{|.,|{(((({.,..}}})))}..,,,........,..,,,,{{({((((((..,,,})}}})}).}},))))}}||||{|{{|{..{{|||{{,((((((((....{{{..{{,,..{{{.,......))),..,.}}}))))))))..((.(((((((((...(((...((.(((((.(({{,..,......,.))}}..))))).))...))).)))))).))).)).,,,,..,||}}}})))).,,))),{{{||,,|{{{,(((({{,{..,,||||}|}.}}}}..))}}||||..}}}}............,||}}}.}}}..{{{|...||||....(((({(({........))))))).}}})),)}}},.........,},)}})))))..,,,..((((((......((((((..((((((..,....((((((((..((...))..)))))))),..))))))..))))))))))))|||{|,|...,,,},)))))))).))),.)),..))))))....))))))....
Forensic Context

No forensic context available.