Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0055
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33308229-33363232 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33286683-33341686 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-414.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -447.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 424.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..(((((((((.(((((.(((((..((((.(.((.(.(((((((((..(.((..(((((...((((......))))............))))).((((((((((..((((((((((((((((((..((((((((((...(((......))).))))))).(((((((........(((((...((((((.....))))))))))).(((((((((((((.((.......((...)).......)).))))))..)))))))..(((((((((.....))))..(((((((....)))))))...........(((((((((((((((((((..((((((((((.....)))))))))).)))))).(((((.....((((((....(((((.((((....((....((((..(((.(((((((((((.((((..(((.(.((...(((.(.(((((...........))))).).)))....((((((.................((((........))))))))))......(((....(.(((((((((((((((((..(((..(((((.....((((((...............((((((........))))))((((....((((.(((........)))))))....))))...........))))))..)))))..)))..))..))))))(.((((((..((((((.......((((((((..((...))..))))))))...))))))..)))))).)(((((((..(((......((((((((((((.........((((((((((((((((((.((((((((........)))))))).....((((((....))))))..)))))).)))))))).)))).((((((((..(((((((((..(((((((((.....)))))((.((((.((((((......))).))))))).))......))))..)))))).(((....)))...(((((((.....))))))).)))..))))))))...)))))))).))))))).)))))))))))))))).)...)))..)).).))))))))))).))).))))..)))..))))....))...)))).)))))..((((((((.(((((....(((((.((((.((.(((((.((.((.....(((..(((.((((((.....)))))).))).((((((((...(((((((.......................)))))))...))))).)))..))).....)).)).)))))))..)))).)))))..))))).)))))))))))))).)))))...(((.(((......))).))).....)))).)))))))))..))))).)))))))((((.........))))..)))..)))))))))).......).)))))))((((....))))...((((((..........((......))..........)))))).......))))))).)))...)).)..)))).....((....)).))))).)...)).)))))..)))))))))).))))).))))..))))....((((.((.(((.....))).)).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..(((((((((.(((((.(((((..((({.{,({.(.(((((({{{..{.,,.,(((((,{,({((,.....||}|.,,,||,...}.))))}.{||(((((((.,((({(({{((((((((((,(((((((((((((.((({{{{..,}}.},)))),.)))}}))))))).}}|((((...((((((.....)))))))))),.(((((((((((((.((.......{{...)).......)).))))))..)))))))..(((((((((.....))))..(((((((....)))))))...........((((((((((((({(((((..((((((((((.....)))))))))).}}}}}}.{((({,....((((((....(((((.((((....{{....((((..(((.(((((((((((.(((((((((((((,..{((..,((.(((((.(({{,..,,,{,.,,,|}},..}}}}}.}}...}}}.}})))),)))|||,,.,,..,))}{(((({{.{.{{{.,,.(({..,,,}||.,}}}.}.})))))},,.|||||,,}}}|||||{,,,,...........{(((((........)))))}((((....(({({(((........)))))))....))))......,{{||,,,}}}.,)))))...(((((((((((((.{(((((({.,{{,{((((((((.((((({((..{{.,,||,.}}}))))},{{||.....})}}}))})).))))}.))))}}},..(((((((((((({.,{{{((((,{(((((((({,{{,,,.||{((((|,,,,....}||}}}}}.||,.{{{{((..,{||||,,..)))))).))})))))))))},{(((((((..{{(((((((..(((((((((.....))))){{.{(((.{(((((......))).))),}))}}},,,,..))))..))))))}|,{....}},...(((((((.....))))))).,}}..)))))))}.},}))))))).))))..,))))))).)))))),.............))))))))))))))).)))},)))..)))..))))....}}...)))).)))))..{(((((((.(((((....(((((.{(((.((.(((((.(({((..{,.,{,..{(({((((((,....}}||||,|||.{{{{{|||,}}||(((({...,,.,,,,.,,{{...,,...))))))),..,}}}}.)))}}})),,,.,)),))})))))})..)))}.)))))..))))).)))))))))))))).}}|}|...,{|,,{{,.....}}},}},.....)))).)))))))))..))))).......{((((.........)))))......)))))))))).......}|}))))}}|(({....)))}...((((((....,,.,,.({......}}.,...,....)))))),......))))))),||}.,..}.}.,)})).....((....)).))))).)..,)}.}))))..)))))))))).))))).))))..))))....((((.((.(((.....))).)).)))).
Forensic Context

No forensic context available.