Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0270700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0026
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:33318722-33320940 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33297176-33299394 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-841.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -877.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 388.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((.(((((((..((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((.((((((((((.(((((((((.(.(((.((((..(((......(((((((.........))))))).......))).)))).))).).))))))))).)))))))))).)))))))))))))).)))))))))).))))))..))))))))))))))))))))))..))))))).))))).)))))).))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))..))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))(((....)))((((((((((((......))))....((((.(((..((......)).))))))).......))))))))...............((((((((((((((.(.....).))))))(((((....)))))....((((((((((...(((((((....(((((...............................((((((......))))))....((((.(((((((((.(((..(((((((....)))))))..(((((............)))))((((((........))))))......(((((.((...((((...))))...))..)))))((((...........(((.(((((...))))))))...........))))...(((((((((.(((.(((....((((((...))))))..((((....((..((((.........))))..))...))))...))).))))))))))))..))))))))))))))))(((((((.(((.......)))..)))))))........((((((((...((..((.((.(((((....))))).))))))...)))))))).............((((....))))...(((((....((((..((((((((...................))))))))....)))).))))).....((((((((((....)).....(((((..((.((.(((((((.......))))))).)).)).)))))...((((.((((((..((((..((((...((((..(((....))))))).....)))).))).)..))))))....))))(((((.((.(((((((((((((.(((.((((((((((..((((((....))))))......(((((.(((.(((((((.(((((((.(((...)))...)))))))..)).)))))...))).))))).((((..........))))...)))).))).))).))).)))))..))))))))...)).)))))(((((.((((..(.((((((.((((((..((.(......).))..)))))).))).....((((((((......))))).)))))).)..)))))))))..........................))))))))......))))))))))))...)).))))))))(((((((..(((((((((...(((((....))))).......(((((..(((.((.((((((............)))))))).)))...))))).....(((((.....)))))....(((........))).((........)))))))))))...)))))))))))))))..................)))(((((((.(((...(((..(((((((((((((((((...((((((.((.(((....))).)).)))))).....((((((((((((...((((((((.......(((.....(((((......).))))...)))......))))...)))).)))).((((.((((.((((..(.(((((..((((((....))))))(((((.(((((...((.(((.((....)).))).))....))))).))))).))).)).).))))))))))))..................))))))))(((((((..(((....)))..))..)))))..))))))))...)))))))))..)))..)))......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((((.(((((((..((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.((((((((((((((.((((((((((.(((((((((.(.(((.((((..(((......{{({((({........}}})))).......}}}.)))).))).).))))))))).)))))))))).)))))))))))))).)))))))))).))))))..))))))))))))))))))))))..))))))).))))).)))))).))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))){{|....}}}((((((((({{((...,{|{||..{,{(((.{{{.,||,.....},.)))))}}..,,,.}))))))))...............((((((((((((((,(....,).))))))(((((....)))))....(((((((({(,..(((((((....(((((...............................{(((((......)))))}....((((.(((((((({.,,,..(((((((....)))))))..((((({..,....,..})))))((((((........)))))).....((((...(.((((((....,,.,...,......)))))).,...}}}}..{({.(((((...))))).}},.,,......,}}{|...(((((((((.(((.{{,....((((((...))))))..,{{{....{{..{{((,,......,))))..))...))}}...,,,.)))))))))))),}}))))))))))))))){{{((((,,,.,,,,,}})},..,,|||||,,,,....((((((((...,,.,((.((.(((((....))))).))})))...))))))))..,.,|||||,..{{||..,,}}}}...((({{.,..{(({..((((((((.{{.............},.))))))))....}}},.})))).....(((((({(((....)),....(((((..((.((.(((((((.......))))))).)).)).)))))...((((.((((((..{(((..((((..{((,({.,,,}},,),|}},,...,.)))).))).)..))))))....}))){((((.{{.(((((((((((((.(((.((((((((({..((((({....})))))......(((((.(((.((((({{.(((((((.(({...}))...)))))))..}}.)))))...))).))))).{{{,..........}}}}...)))).))).))).))).)))))..))))))))...)).))))}(((((.((((..{.((((((.((((((..((,{....,,).,}..)))))).))}..,,.{{(({{,{,,,,.}))))).}))))).}..))))))))),.........................,}))))))...,,.))))))))))))...)).)))))))}(((((((..{((((((((...(((((....))))}.......{{{((.((,,,((.((((((............)))))))).}),,}.))))}.....(((({.....)))))....({{.,,,,...}))}|{........))))))))))),..)))))))))))))))........,.,.......)))(((((((.,,{,..(((..(((((((((((((((((...((((((.{(.{(({...}}}.)).)))))).....((((((((((((...((({{{(({,,....(((.,,..(((({......}.)))).,}))),,.,},}}},..,)))).)))).((((.((((.(((({.(.,.{({..((((((....))))))(((((.(((((.,,((.(((.((....)).))),)),...))))).))))).}}).},.).})))))))))))..................))))))))(((((((..(((....)))..}),.}))))..))))))))...)))))))))..)))...,,......)))))))
Forensic Context

No forensic context available.