Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0270800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0024
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:33322396-33323211 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33300850-33301665 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-210.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -228.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 174.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((((.((.((((((((...((((..(((((.((.((((.((((((((((((.....((((((.((.(((..((.........))((((((.((((((((..((((((.((.(((((((((((.((((((.(((...((((......((((((((((..((((.((((((((...((((((....(((....((((.......))))..)))....))))))((....))....(((((((((......................)))))))))....................)))))))).))))..)))).))..))))(((......)))........(((((....(((......)))......)))))))))...)))............((((((((.(((.((((...((((((.(((......((((((....(((((.....)))))...))))))......)))..))).....)))..)))).))).....))))))))..(((((((..((((((((((((..(((.....))))))).)))))...)))..))))))).((((.(((((((......(((...))).....))))))).)))).........................(((((........))))))))))).))))))))))).)).))))....))..)))))))).)))))).))).)).)))))).....)))))))))))).)))).))...)))))..)))).)))))))).)).)))))))).)))(.(((((........))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((((({.((.((((((((...((((..(((((.{{.((((.((((((((((((.....((((((.{(,(((..((.........,,{(((((.((((((((..((((((.({.(((((((((((.((((((.,,..,,,,...,,,..,({((((.(((((,,((({{.,,,,...{(((((,..,{{{..,,||{{{|.....,}},.,},.....,,..{(((...)))}...(((((((((....,.................))))))))}.............,,}},.})))).))))))...(((((((((({(({((,..,,..}|}.,|,.,||{{(({....{(({,....,,}..,.,,)))}}}},,,.{|{{...........,||}|{,,......{{{{,|{((({.((((((........)))))).})))),}}}}.,))).})))))))))...||||,{{{{{..{({({{..{,,{{{.,{,..,})).}))..(((((((..((((((((((((..{{{.....})})))).)))))}..,))..))))))).}}.}))}..})))),}}}|,....||..{{{{||.{{{,...............,,,}}}}},......(((((........))))))))))).))))))))))).}).))))....))..)))))))).)))))),))),)).)))))).....)))))))))))).)))).}}...)))))..)))).)))))))).)).}))))))).)))(.(((((.,....,.))))).)
Forensic Context

No forensic context available.