Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0100
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33350056-33369559 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33328510-33348013 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-327.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -352.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 300.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((.(((((((((((.....))).((((((....)))))).)))))))).))))).).(((..(.(((...(((((((((((.((((.(((((.....)))))((.((((.((((((......))).))))))).)).....(((((.(((((.(.((((..(((....(((((((.....))))))).....(((((....)))))((((((........(((((((((............(((((((((((((..(((..(((..((((((...............(((((....)))))...((((((((.(((((....(((((.((((.((.(((((.((.((.....(((..(((.((((((.....)))))).))).((((((((...(((((((.......................)))))))...))))).)))..))).....)).)).)))))))..)))).)))))..))))).))))))))........((((((..(..(((((...(((((.......(((.(((((((..(((.((..........)).)))))))))).)))....)))))...)))))..).....))))))...((((....))))...((((((..........((......))..........))))))(((.((....))..))))))))).))).)))..))))........((((.((((...((((........(((((((((((((((.....(((((....((((((((.((((((((...((((((.....((((.......((((......)))).((((((.....))))))....(((((((...((((.....))))....)))))))(((((((.((((((((.....)))..))).(((((((.(((((.((((((.....(((((..(((((((.(.(((((....)))))).))))...)))..))))).)))))).))).)).)))))))))))))))).......))))))))))..)))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))..)))))))).))))))))))))))))))......))))))((((.((.........)).))))...)))..)))).))))))...)))))))))...))))))..)))))....))).)..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,(((((.(((((((({{{{{{{.|{{,.,,|||.,}})}}}...}))))))).))))).).(((..{.(((...(((((((((((.((((.(((((.....))))){(,{(((.{(((((......))).))),}))}),.,,,.(((((.(((({{(.((((..(((....(((((((.....)))))))...,,{(({{...,}))},((((((.{,.....(((((((((............((((((((({.((.((({,(((({{{{.,,..|||,..........(((({....}))))...{(((((((.(((((....(((((.{(((.((.(((((.(({((..{,.,{,..{(({((((((,....}}||||,|||.{{{{{|||,}}||(((({...,,.,,,,.,,{{...,,...))))))),..,}}}}.)))}}})),,,.,)),))})))))})..)))}.)))))..))))).))))))))........,((({{..|,|{{{{|,,,|||||.......{((,(((((((..(((.({..........}).)))))))))).))}.,..,}}}}...}}}}}...,....)))}}}...{(((({.{{|({...((((((.....,.,..{,......}}..........)))))),{,..{..((((.(((......))).)))),...}}|{....,,.,|||.||||}..||||}},,....(((((((((((((((.....((({,....((((((((.(((((((({{.,{{,(((....}}},....,,.((((......))))}|,,,.,.....||||,,....{((({,....,})))}..||{{|||,..{,(((((((((((.{({({(((.....)))..}}}.(((((((.(((((.((((((.....(((((..(((((((.,.(((((....)))))).))))...)))..))))).)))))).))),,).))))))))})))))))...}}))),))))))))}.)))))))))))))))),}.)))))),}))))))))))}})))},)))),))}.))))))))))))))))))......))))))((((.{{,,......})).)))).,,)))..)))).))))))...)))))))))...))))))},.})))....))).}..))).
Forensic Context

No forensic context available.