Basic Information
Symbol
hsa_HIPK3_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0060
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:33352487-33353202
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33330941-33331656
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-220.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-234.74 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
188.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((.(((...((.(((((.........))))))))))...........((((((..(....)..))))))....((((((((......))))))))(((((..........))))).))))))((((...(((((.((((.((..((((.........)))).)))))))))))..))))..((((...((((((....))))))...))))...))))))(((.....((.((.(((((((.....(((((((....).))))))...))))))).)).))..((((((....(((((((((((.(((((((((.((((((....)))).))...(((((.((..(((((((.........)))))))...)).)))))((((((((.(((((((.(((((......((((.....))))))))).)))))))..........((((((.......))))))......))))))))((((((((.........)).)))))).(((((.(.(((((((((.(((((..........)))).....).))))))))).).))))).(((((((((....)))))))))..))))....)))))...)).)))))))))........))))))...((((.((..((((....((((.((((...............))))))))....))))..))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,({.....)).}))(((..{(.(((....(((((((....((((((,......((((((..(....)..))))))....((((((((......))))))))(((((..........))))).(((((((((..,{((({(.{(({.(({{((((.........)))).)))),,,}}}},....,...,{(({,((((({....})))))...{((((.{{.{,..,}..)))))}}}|,,{{({,....{,(((({{{....},)))}},.,,})})))}.}},....}},,}}....)))))))))},.)))))))....))))}.})...))).)}|,(((((,{,..(((((((.........))))))}...,}.}}}}},{((((((.{{{{{{{,(((((,,,,,,({{(,,.,,||}}}}))),})))))),,........((((((.,...,.)))))),}}}}}))))))}|((((((((.........)).))))))}(((((.{.(((((((((.{((((.....,,,,.}},,.}}.,}.))))))))).).))))).(((((((((....)))))))))..,{{{,,,{{.......,||||||}}|},.,.)},)),},,,,...((({,((..((((....((((.((((...,,.....,,...))))))))....))))..))))))....)))
Forensic Context
No forensic context available.