Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0006600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0014
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33358621-33370364 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33337075-33348818 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-391.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -420.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..........)((((.((.....((((((((.....(((....)))...(((((((.....)))))))....((((((((......(((....)))(((.((((((((...((((....((((.((....((((((((...((((.........))))..........(((((....)))))...((((((((.(((((....(((((.((((.((.(((((.((.((.....(((..(((.((((((.....)))))).))).((((((((...(((((((.......................)))))))...))))).)))..))).....)).)).)))))))..)))).)))))..))))).))))))))..)))))).))..))))))...(((((((((((........(((((((((..(((.((..........)).))))))))).)))(((((...(((((.(((.......((((((((...))))..)))).....((((((..........((......))..........))))))(((((..((.(((((((((((((.(((((..((((..(((((((((((..((((............((((((.(((((..((((....))))((.((((((((((((.(((...........(((....))).....((.((((......))))))..........))))))))))).)))))).........((.(((((.(((((((((((((........(((.....)))(((((...((((((...)))))).)))))..(((((..(((((((.(.(((((....)))))).))))...)))..)))))....(((((((((((.(((((.((((((.....))))))((((((((..((((((..(.(((((((.(.....).))))))).)..))))))....))).)))))............((((((....))))))...)))))..))))))))))))).))))))).))))...))))).))...))))).))))))............))))....)))))))))))))))...)).))).)))))))...))).....(.(((((((((((((....((.((((((.(((......)))))).....))).))....))))))))))))).)...........)))))...))))).))))))))..)))))...)))).)))))))))))..))).))))).)))..))))))))..((((((((((....((((((......))))))......)))))......)))))))))))))........(((.(((((...)))))..)))(((((((((.((..((((((........)))))).(((((...)))))..))))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..........)((((.,,.....((((((((.......,.{{{{{{...(((((((.....)))))))...,{((((({,...,,,,{{....}}|(((.((((((((...((({....(((,{((....((((((((...((((.........))))..........(((({....}))))...{(((((((.(((((....(((((.{(((.((.(((((.(({((..{,.,{,..{(({((((((,....}|||||,|||.{{{{{|||,}}||((({{...,,.,,,,.,,{{...,,...))))))),..,}}}}.)))}}})),,,.,)),))})))))})..)))}.)))))..))))).))))))))..)))))).))..))))))...(((((((((((.,,,..,{({(((((((..(((.({..........}).)))))))))}.))|||{{..,((((,,((({,..{{,((((((((...}||}..}})),,...((((((.....,.,..{,......}}..........)))))),,,,{..,{,{{{(({(((((({,(((((..((({.,(((((((((((,.{((({,,{,(({{..,..{((((({(({({(({{..,,|{|{,,...,|{,{{{{{}||{||||||}}..|.{||},,,)))}}...{{,((((,..,,,|}}},|.,,.......(((||{{{,,{(((({,...||||},..,||||{{..||||||{(((((((.{{{{{(((.....)))..}}}.(((((((.(((((.((((((.....(((((..(((((((.,.(((((....)))))).))))...)))..))))).)))))).)))}}).)))))))}})))))))...,,}}}{|||||||,.{|||||,,|,|||||||.{.,,,.),}}))))).)..))))))..,,))),))))}..{{{{{....,||||{{....))))))||||,,,,..,},,,}))))))}.}))),}},)}})}|||||||,|,,{,|.|||{|||||,..........}|||||,,..}})))))))))))))...}}.,,},)}})))).}}))),..,.{.(((((((((((((....((.(((((,{(((......))))}}.....))).))....)))))))))))))||....,...,,,,)))}..,}}}))},,)))))),}))))),,.)))).)))))))})))..))).))))}.)))},||||,,,,}}|||,((((((,,..((((((......))))))..,,..))))))....,}))))))))))))........||{.(((((...))))).,|}|(((((((((.((..{,{({{.,,,....)))}}|.(((((...))))),.}}))))))))))),))))
Forensic Context

No forensic context available.