Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-HIPK3_0077
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:33358741-33360261 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33337195-33338715 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-431.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -459.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 285.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........(((((((((((((...(((((..........(((((((....(((.(((((((........))))))).)))...)))))))...........((......(((....))).....))..)))))......)))))))))))))..(((((((((((((((........((((.((((...)))).))))(((((((.(((((((((((((.((((...))))))))))))..)))))...)))))))...(((((.((((....((((((..(....)..))))))......(((..(((((......((((((((..............(((.(((((((((..((..((((((((..((((.((((((((..........)))))).............)))))).))))))))..(((((..((((((((......)))))))).....)))))...............((((.((((.....)))).))))....(((..((((...(((.(((((.(((((((.((.......)))))))))...))))))))..))))....)))))..).)))))))).))).......))))))))......)))))..)))((((.(((((((((((.............((.(((((...)))))))...)))))))))))))))..........(.((((((((((((....(((((((....)).))).))..)))))))))).)).)((((((((((((((((...(((((((...((((....(((.(.(((((.(((......................(((((((((...((((((.......))))))............(((((....))))))))))))))(((.((((((((((.((((((...............)))))).))))).))...))).)))........))).))))).).)))....)))).)))))))((((.((((...((((((((((((........))))).....))))))).)))).))))((((((((...))))))))....)))))).))))))))))))))..)))))(((((..(((((.........)))))..))))).......((((((.......(((((((((((.((...((((((.((.....(((((.(((((...........)))))(((((((((.....(((((.((....)).))))))))).))))).......(((((((...(((.((((....)))).)))...)))))))..)))))....)))))))).)))))))))))))......)))))).((((((....)))))).....(((((......))))).....................(((...(((((((...(((((......)))))...)))))))..)))(((((......))))).....((((((......))))))..))))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.........{((((((((((((...(((((...,{,....{((((((....(((.(((((((........))))))).)))...)))))))...........,.......,||....}||....,))..})))).,,,,,))))))))}}})).,((((((((((((({,........((((.((((...)))).))))(((((((.(((((((((((((.((({...})))))))))))..)))))...)))))))...(((((.((((..,.((((((..(....)..))))))......(((..(((((......((((((((..............(((.(((((((((..,,..((((((((..((((.(((({,(,.,.,..|...,))}))|........,.}.,.)))).))))))))..(((((..((((((((......)))))))).....)))))...............{,,..,,,,.....)))).,}}|..{{(((..((((...(((.(((((.((((((({{,.......)),))))))...))))))))..})))....)))))..},)))))))).)))....,,,))))))))......)))))..)))((((.(((((((((((.,,({(.{{,...,,)})}}|}|{|,...,))..)))))))))))))))..........,.((((((((((((.,..(((((((....)))),).))..)))))))))),}}.}((((((((((((((((..,{(,(((({...|||}}..||{,(.{{{((..........................(((((((((...{{{{{,.......}}}}}|.......,,,|,((({{....})))}})))))))){{{,{{{(((((((.((((((.............,.)))))).))))).))...}}}.}}}........},,.}}))),).)}),},.},,,.}|||||,,,,,.,,,},},|(((((((((((........))))),,}},}}}}}}}......{((.((((((((...)))))))).))})))))).))))))))))))))..)))))|((((..(((((.........)))))..))))}.......((((((.......(((((((((((.((...((((((.((.....(((((.(((((...........))))){{{{({((({,,..,{{{(.,,,,,,|,.})))))}}}.)}}}}.,,,,,,(((((((...(((.((((....)))).)))...)))))))..))))).,..)))))))).)))))))))))))......)))))).((((((....)))))).....(((((......))))|,,.................|.{.{,,,{{{{{{{|,.,,.||,,,||.})))}.,,....)),,.,,}||||,....,,}||{{{,,,..}}}}}....,})}}))},,))))))))))))))),
Forensic Context

No forensic context available.