Basic Information

Symbol
hsa_AFF1_0015500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AFF1_0074
Host gene
AFF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:88059492-88060841 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:87138340-87139689 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-303.85 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -330.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...(((.....((((((.((((....)))).)))))).....)))....(((((((...((((((((((((((((..((.(...(.(((.(((((..(((((((....((((....(((((.((((...))))))))).))))..))))))).))))).))).)...).)).))))))).))...(..(((((((...(((((((..............)))))))..)))))))..)..........)))))))....))))))).(((((((.....................................((((((((..((..(((....)))....)))))))))).(((((((((((((((((((((...((((((((..(((.(((((..(((.((.((((((((((((...((.(.(((((((((((.....)))).......(((...(((((((((.....((((((((...((((((((...........))).)))))..))))))))...))).)))))).....)))))))))).)))....)))))...((((((...(((........)))...))))))...((((((((.(((((((.....(((((((.((((...(((((((.(((....((((..((((..((((..((...((((..(((((.((((((...................)))))).........((((((.....(((((.(((((((...((((((((....(((.((((((........(((..((((....))))..)))...))))))..)))..))))))))......(((..((.((((((.((((...........)))).)).....)))))).)))....)))))))...)))))))))))........))))).)))).....))..))))..))))...))))....))).)))))))..)))).))))..))).....)))))))...)))))))).....))))))).)).)))..))))).)))........)))))))))))).))((((((..................................................))))))...))))))))))))))).))))))).....(((((((((.......(((((((.((((....)))))))))))))).))))))((((((((....))))))))....((...)).(((((((...(((......)))..)))))))..)))(((...(((..(((((.....((.((((..............)))).)).....))))).....)))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,(((.....((((((.((((....)))).))))))...,.}}},...(((((((...((((((({{(((((((..((.(...(.(((.(((((..(((((((..,.((((....,((((.(((,...}))))))),.)))).,))))))).))))).))).)...).)).))))))).}}.,{{.{(((,,{({{{(((((((..............)))))))....})))),))))..)}}.,,)))))))....))))))).(((((((....,,,..................,,,.........((((((((..{(..{((....)))},..}})))))))).(((((((((((((((((((((...(((((((({{((,.((((({{(((,{(,((((((,(((((...((.(.(((((((,,,......||,,..,|,..(((...((((({{((,.{{,((((((((...(((({(((...........))).)))))..)))))))).,})}),)))))).....)))))))))).)))....))))),,,((((((...(((........)))...))))))...((((((((.(((((((.....(({{(((.((((...(((((((.{{{...,(((,..{({{..,{{{,,{|,.,{(({..(((((.((((((...................))))))....,,|,.((((({....,(((((.(((((({...((((((((....{((.((((((........{({..(((,....)))},.)))...))))))..},}..))))))))...,,.(((..((.((((({.((({........,..}})).))},}.})))))).)))..,})))))))...)))))))))))...,..,,})))},}|||.....}},|}|))|.})))...))))....))).)))))))..)))).))))..))).....)))))))...)))))))).....},})))}.})})))},))))}.},,..,}}}..))))))))}))).))((((((..................................................))))))...))))))))))))))).))))))).....,{{{{{{{{....,,,(((((((.((((....)))))))))))))),}}}}},{(((((((....)))))))}....,,..,)).(((((((...(((......)))..)))))))..)))(((...(((..(((((.....((.((((....,......,..)))).)).....))))).....)))...)))
Forensic Context

No forensic context available.