Basic Information
Symbol
hsa_HTRA1_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0020269
hsa_circHTRA1_001
Host gene
HTRA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:124221041-124274424
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:122461525-122514908
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-828.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-865.24 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
787.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((((((((((((((((((.((((((.((....(((((((((((((..(.(((((((((.((((..((((((.(...((((((...(((((..(((((.((.(((((((((.((((((((((.((((.(.(((((.((((((((((.....(((((((.(.(((((.((.(((((((((((.(((...(((((.(((..((((.....((((((((((...)).)))))))))))).))).)))))))).))).)))))))).)).))))).).))))..)))))))))))...)).)))))))))))))))).))).).)))).)))))(((((....)))))...)))))))..))))))))))).).)))))).))))..).)))))).)).)..)))))))).).))))....))...))))))))))).))))).))))(((((((((.(((((....)))((((((((((((..(((......))).)))))..(((......)))((((((....((((((.(((((.((((.((((((((...(((((.((.((.......)).)).)).))))))))(((((((((((((((..(((((((.(((((((((..(((((......)))))))))))).)).)))....))))...))))))((((((((((((..(((((((((.((((((((((((...))))).))))....(((.((((((((((.(..(((......(((........))).......)))..).)))))).)))).))).....((((((......(((...)))......))))))..))).))))))...)))....))))))((((((...((.......)).))))))......))))))(((((((.......)))))))...)))))))))..))).)))).))))).(((((((..((.(((..((...))..)))))))))))).......(((.(((.((...))))).))).((........))..))))))....)))))))))).)))....)).)))((((.....))))..((((..((((........))))....))))))))))(((((((.....((((((((((..(((((.(......(((((...)))))..(((.(((((..(((..((......((((....))))......(((..(((.((....)).)))..))).(((..((((((((((((....(((((((.........((((..(((((((((((.((....(((((((..(((..((((((((((..(((....)))..)))).((..(((.(((((.((((.((.......(((.((..(((((((.((((((((....))))).))).)).)))))....)).))).....(((((.((.(..((((.((((.((((.((((((((((((...)))))))))....(((((..(((..(((.(((((((.((..((.......))..))))))))).)))..))).))))).................))).)))))))).))))..))).)))))..........)).)))).).)))).)))..)).)).)))).))))))))))..)))))).))).....))))..))))((((((((.((.(((.(((...)))))))).)))))))).)))))))...((((((((.((..((....))..)))))))))).....((((((...))))))...((((((.......)))))))).))))))))))))).))..)))..))))).))).((((((.......))))))...........).))))))))))...))))))))))))))))).)).(((((.(((...(((((......((((...(((((.......))))))))).....((((..(((..(((((((.(((((.((((..........))))(((..((((.((((....))))))))..)))((((((...(((.....))).....))))))..))))).))....)))))..)))...))))..........)))))))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,.((((({((((({(((((((({((((((.(({{({{((((({(((,((((({((((((,,{.,{{{,{((((((.{...((({{{,,.{{{({.,(((((,{{{(((((((((.(({{((((({,((((.{.(((((,{(((((((((.....(((((((.(.(((((.((.(((((((((((.({{..{(((((.(((..((((.....((((((((((...)),}))))))))))).))).))))))}).))).)))))))).)).))))).).))))..))))))))))).}.)).)))))})))))))))),)}),).)))).)))))|{||{.,,,))))),).).))))).})))))))))))}).)})))).}))).}),))))))})|,|||{.,}})))}))||||{{{||,..{|||||||||||{|||||,}||||||||{,((((({{,,,,.||}|{|.||||||{|||(((,{{...||}.,}},...,|,.....,)})},.}}})))))))))).)}}))})|||,{{|||||}|{.,||||||||||||.,,(({(((,,{{{({({({||((((((({{((((((..(((((((.(((((((((..(((((......)))))))))))).)).)))....))))...)))))){||||{{{,,,{{{,,,{{||||,,.((((((((({...})))).))))},,.(({{(((,{({{(({({.((,.{((({(((((..,.{,{||||||.|,|||..,.||||}}{||||,||}.....((((((..{{..(({...}))...,..))))))..|,,.||},,|,....,...,)}}}))((((((...((.......)).))))))......|}}||}(((((((.,.....))))))),|.|||||||||..||,.,}},.)))))}{{({{{{..{{,|||,,{{...||..}}))}})))))}.......{{{.|||,||,,.)))}}.|}|.{{....|,,{||,,||,{||...,,||||||||||||}..,||||||.((((.....)))},.((((,{({{(,,,,..,,|}||..,,||||{.,,)))),,,||...,||||{|}}|||.|||,||||{,,,..{((((,..,}|||...{{{(({...|||,,{{{..,,,,((((,...}}}}......,|{||,,,,||}|||}}.||,{,,,,.||,}}|||||..,|||,,,,,((((((({{||,,,||{|{{|,||{,{{{{{||,||,,,,||{{{(,.,(((..(((({{((((..(((....)))..))||{((..(((.(((({.((((.((.......{({.({..(((((((.((((((((....))))).))).)),}))))....|},|},.....,{{{{,,,,({,{{{|,|||{{({{{.((((((((((((...)))))))))....(((((..(((..(((.(((((({{((..((.......))..))))))))).)))..))).))))).................))).||||||||{|}}}..}}),))))),,.,,.....)).)))).}.)))).)))..)).)),}))).))}))))))}..}||}||.|||,....}))),.)))){(((((((.(.((((.(((...)))))))},)))))))}.,,,},}|...{{{((({|{({..{(....))..)))))))}}}..{||((((({.,,}))))}..,|||||{,...,}.})))))})})))))))))))}||||||.{|||..,,|||},.{({{{{,,,||.,}))))},,.......,{{{{|.......)))))),,,.||.,{{{{.,,,,,,}},)))}))}}},{,|{{||||,,{||,|,|{|||,,,,,,,)))))),})|,.|.|}}}}}}},..{{{{{,(((((,..((((..........))))..},,))}}}}|||})))))))}}}},.,))}}||||},}|||},...})),,.,,}}))))|.||}|||||,..,}),}))).))}},}}},|.,,,,}}}..,,},}})})}},)}
Forensic Context
No forensic context available.