Basic Information

Symbol
hsa_IARS_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087470 hsa_circIARS_039
Host gene
IARS
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:94984802-95022516 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:92222520-92260234 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-533.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -572.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 712.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.............(((((((....((....))....))).))))))))))((.....((.((((((((((..(((((((.....((((.....(((((....)).)))(((.((.....)).)))...((((((.(((...((((.((((((....)))))).)))).)))..((((...)))).....))))))....))))....)))))))((((....))))(((((..(((((((((((......)))))...(((((((((.((((....((((.......))))((((((((.((((((((((((((((..((((((((.((((.(((......))))))).))........(((((((...((((((((((((((........))).))))))...)))......))....)))))))..((((((((((((...(((((.((((..(((((((((((((((((((.......)))))((((((((((.(((.((((...((((.((((((((.(((((((((.....(((...........))).....))))))).))(((((((((((((((..((((..(((((((((...((((((..........))))))....))))))........))).))))..)).)))))).).)).))))...((((((((.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........(((((.........((((((...((..((((((....))).)))..))......((((.((((((.....))))))))))........(((((((...))))))).(((((..((((.(((.................))).)))).))))).))))))(((.((((.......)))).))))))))))))))))))))))))..))))((..(((((.....))))).))......)))).))))))).))))))(((((((....)))))))(((....)))...)))))))....))))))).......)))).))))).))).)))))))))))))))..)).))))))))).....)))))((((((.((((((((((.(((((((((.((((..(((((((.(((.(((.....))))))..((..((.(((((.....)))))))..)).....((((..(((.((....((((((...(((((.((.....)).)))))...)))))).....)).)))))))(((((...(((((((...((((...........)))).(((((..(((........)))..)))))....(((((........)))))....)))))))...)))))...............(((..((((((((((...((((............)))).)))...)))))))))).(((((((((((((.((((........)))).))))))...))))).)).......(((((...)))))((((...))))...))))))).))))..)))))....))))))))..((((....)))).))))))..))))))....((((((((.((.((((.(((......)))))))..........(((....(((((...)))))....))).....))))))))))....))))))))))))...)))))))))....))))))....)))))...)))))))......(((...(((((.(((.((.((((....((((((((((.((....)).)))))))))).((((((((........))))))))...((......))(((..(((((((.....))))..)))..))))))).)).))))))))))).(((....)))(((((.....)))))))).))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,,......,,.,.{{{{(((....{,....})....))).))))))}))){({{,,.{{.{(({(({{{{|,{{((((({...}|||||....{,{{{{,,{{{{|{((((.({.....)).)))}}..{{{{{||((.{,((((.((((((....)))))}.)))).}||,,((({...,||||||.||||||}..,,{|||....)))),||(({(,..,||||(({{{..{{({{((((((......)))),...(((((((((.{(((....,.,,.,.....}}}}((({((({|{{{{{{{(((((((.,..,{,,,,,,.,|||}|||....|||}}|||||||,,..,.,,||||||{||{,.{{{{{(({{{{({(({.,.{{(((((({,,...,,,..}}))))))}.,,,})}}|.{(((((((((({...{{(((.((((..((((((((((((((|{{,,.,|....}))))|(((({({,{{(((.|(((.||({|,.((((((({.||{({({{(,,...{{{....,.,....}}}.....}}}||||{||({((,(((((((((({,((((..{,,((((((...((((((..........))))))....))))))........}}},||}}|,})}}}}))).|,}|.))}},,,{((((({(.((((.(((((..((((....))))))))).))))..........{((((...,,{.,,{{(({{...((..{(((((...,||}.}}},,|},....,((({{((((((.....))))))))))..,,....(((((((...))))))).{(({{..((({.(((((,,..........,,.,)).}))).})))},||,|||({{.((((.......)))).})))}}}|)}))}))|})))))))..||,|((..(((((.....))))}.}}..}}..)))}.))))))}.}))))}(((((((....))))))){{(.,,,|}},..))))))),...,)))))).....,.)))},}}))).,.)})))))))))})))}).}))}))}}|||}|{..{{{{{||,,,.,||||||||{|||||||||}|},,,...({,({((.(((({((((.,,..|,},......,})).)))}))}))}.}|}}||,...,....{{{{..{{{.{{....{(((({.,.(((({.{{.....)).})))).,.))))))....,}),))))))),,}|,...|}}}|||.,.}}||,..,,..,{.{{{{|{{{{|,,...{{{.|{{{|,,||||||||||||{|,||....,,,,|||}}|||,,,|||,...|||||,.{((((............))))}}))))}})),|)))).,,.,,,.|,.,|||||||,.,|,}}}.|||||{((((((((((((.((((........)))).))))))...))))).)}.),})).(((((...))))){(({...)))},,,((({{(({{{.,|||.}}}}}}....|}}},.,||}))}}}}}|||||,|||,|}||||,,...}}}|||}}|||,{{((.{((......}},}}}}..........,,,...,|{{{{...)))))...}))),,....)))))))))).}}))))))))))))...)))))))))...,))))))...,))))),,|}}}}||.......,.,,},|||}|}|.,}|,..||||...{(((((((({.((....)).)))))))))).{{{|||{{...,,|..,,)))}}}..,||.,,,,.}||||..||{||||,,...}}}}..}|}..}|||{{|||}}||||||||||},{{{....}))|||||,,...)))}})}},})}}.))
Forensic Context

No forensic context available.