Basic Information
Symbol
hsa_IARS_0011300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087495
hsa_circIARS_005
Host gene
IARS
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:95021136-95050564
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:92258854-92288282
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-573.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-610.99 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
378.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.....(((((.............)))))((((((.....(((((((((..((((((.(((((((((((((((((.((......((((((((((.(((.(((((((.........(((((((((..((((.((((((((..(((.(((....(((....................))).....))).)))....)))))...))).))))(((((((.......(((.(((.((((((((............((((((((((((....)))))..)))))))...........))))).))).).)).))).......)))))))))))).)))))))))))))).))))))))))((((......((((((((..((....))..))))))))(((.((..((((((((.........))))))..))..))))).((((((....((((.(((....(((..(((((((.......)))))).)..)))))).)))).....)))))))))).)).)))))))))))))))))..(((....)))....((((.......))))..))).))).)))))))))..((((((((((((((((.(.........).)))))))..(((........))))))))..))))(((((((..(((.((((((((.....))))).............(((((.((((...(((((((((((.......))))....(((.(((((....))))))))....((((((((((..(.((....((((.......))))((.((.(((....))).)).)).......((((((((((..((((....(((.((.......)).)))..))))....((((((...((((...........))))...))))))..)))))))..))))).)..))))))))))...(((((((((....((((......))))......)).)))))))((((((......))))))))))))))))).)))))....))).))).))))))).((((((.((((((((..(((..........)))((((........)))).......((((((.((((.....)))).)))))).))))))))....))))))((((((((....((......(((((........))))))).))))))))........((((.((((((.....((........))......(((((.....)))))..((((....(((((...))))).....))))((((((....))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..(((.....((((...)))))))))))...)))).))).))).))))))..........((((((((((((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((..((.((((...)))))).(((((((((.((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).)))))))..(((((((((((...(.(((.((((((((.((......)).))).)))))..))).)...))))))...((((((..((((((((.((......)).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))..................))))))))))).....))).)))).)).)))))).))).))))(((((...)))))....((.(((((......(((((.((.....)).))))).....)).))).))((((.((((((....)))))).))))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))).)))).))))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((({..|,.{((({...........,,|||}}((((({...,,(((((((((..((((((.(((((((((((((((((.({.,,...((((((((((.({{{(((((((,,,.{{{,.,.||||.((((,,,,.||||((((,,(((.(((....{{{..,,.........,|,,...))),....))).))).,..)))),...||,(({||(((((((....,,,(({.{(({((({{{{{.....,.,....((((((((((((....))))}.,)))))))}))},},.,,.))))).)}),).}}.}}}.......))))))))))).)},..)))))))))).)))))))))),{||...,..((((((((..(,....)),.)))))))){{{|{{..{{((((((.........))))))..,}.,,},}}{{(((({....((((.{{{...{{{{..,((((((.......)))))).,,,}))))).)))}.....})))))),,,.}).)))))))))))))))))..{((....}}}....((((.......)}))..)))}})).)))))))))..{{{|,,,,.(((((((.(.........).)))))))..(((........))),,,,,..}||}(((((((..(((.((((((((.....)))))...........,.(((((.((((...(((((((((((.......)))),....{{,{{((((({{{{{{..{{.{{{(((,{(((({....,{...{{|{(,,,,.,.|||||{.||..|,.,,.,,}.,)))}}}.}}..}),))))}|}},((((..,.(((.((.......)).))),.))))....((((((...{{{{.,.........}}}}...))))))...,,((({,,{{((((((((.((,.......}},}}.},,})).)))))))).,((((((........))))))}((((((......))))))})))))))))).))))).}..))).))).))))))).((((((.((((((((.((((..........)))|(((........}}}}.,.....((((((.((((.....)))).)))))).))))))))....))))))((((((((....((......((((({......,))))))).))))))))........,(((.((((((...,,((,,......}}.,{{..(((((.....)))))..||{{....(((((...)))))..,,,}}))|{{(({....))))},..(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..((({....{{{{...}}}))))))))...)))).))).)))}})))))..........(((((((((,((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((.{({.((({...})))}}.(((((((({{((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).))))))),.(((((((((((...{.(((.((((((((.,(,,....,),))).)))))..))).,...))))))...((((((..((((((((.{{......}).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))...,,...........})))))))))))).....)}).)))).)).)))))).))).)))|(((((...)))))}...((.{((((.,....(((((.((.....)).))))).....),}))).))((((.{(((((....)))))}.))))))))))))).)))))).)))))))))))..)))))).)))).))))))}},)))))
Forensic Context
No forensic context available.