Basic Information
Symbol
hsa_DENND4C_0001600
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0138384
hsa_circDENND4C_004
hsa-DENND4C_0002
Host gene
DENND4C
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:19276156-19300329
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:19276158-19300331
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-323.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-352.64 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
366.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((..........((((..(((((.(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).)))))))...((((........((((((((((...((((((((((........))))....(((((.((.((((.....((((....((((((((........((((.(((((((....)))))........)).)))).))))).)))....))))...)))))))))))..((((((((..((((((((((........)))))))))).................((((..(((.((((...(((((.....((((((((......(((((........)))))))))........((((......))))............)))).....)))))...))))))).)))).....(((((.((.....))..)))))(((.(((.....(((((((.....((.((((((.((((((....))))))(((((......)))))..........((((((((((.(((((((......(((((.((((((((((((((...((((((.(.(((.((((((.((.(((.((((...((((....))))...)))).))).))))))))..))).)))))))..((((...)))).......(((((((((.((((...........))))..)))...))))))..(((....))))))))))))))........))))))))....)))))))))))).)))))....))))))))..))))))).(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..))).)))...((((.....))))...((....))..))))))))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((((....))))))).))))).))).)))((((....))))....(((((....)))))(((......)))........)))))))))).......)))).....(((((......)))))..................)))))..))))........(((.(((....))))))((((((((((((.((((((......)))))).((((((((.(((.....((((((......))))))......((((((...)))))).))).)))((.(((((((...(((((.((....(((((((..........)))))))......)).)))))..))))))))).)))))...))))))..))))))..)))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((({(({{{..{{{{{(..({{{{{(({(((((((.((((((....))))))((((.(((((.....))).)).)))).)))))))....,{{......,,{((((({{{{...(((({(((((......|.)))}....(((((.{{.((((.....((((.,..((((((((...,{,..{||,.(({,,|,,||{{{,|{..,...},,},,}}}.)))))}}))....))))...))))}})))))..(((({{{(..((((((((((........))))))))))..........,,,|{{{{{{{{,{{||{{{{...{{(((((((((,..{(,,....,,((((({{{,{{{{|||,||||,....,}},.))),}}|{{||....{{,{{{,.,{||...,,,},|||,.,..},.,}},,.,,.,,,.|{{{||||,},,.,|,{||}}}.{({((......||||{||.}}}}||}||||||}((((((....)))))}(((((......)))))....,.....((((((((((.(((((((......(((((,((((((((((((((,..,{((((.(.{{(.{(((({.,,.(((.((((...((((....))))...)))).))).,,,)))))..))).}))))|{{((((..{{{|||.......,,,.{{||,,||{{.,,.,,))}.,)}}}.{{{{{...)))))..,{,....}}))))))))))))........})})))))....))))))))))))))}})}...|},}|||||,,,||}},,.(((((.((((((((((.....)))))))))).)))))..{||.}|||,,,},,.}}})))}....((....))..))))))))))))))(((.((((((((....((((.........))))......(((((({....})))))).))))).))).))),{{{....|||}....{((((....}}}}}.(({,....},},,,.,,..))}}}))))}.......},,,.....,|||{.,,...}}))},,,,...,,..........}}||||}}||........||..|||,.,}))))))..{||||||,....{((((.......}})))}},|,{{((,{{{..,..,,,,,(,,,...))))}}......((((({...}))))).)},.}))}{,(((((((...(((((.((.,..(((((((.{,...,,..)))))))......)).)))))..)))))))}|{|{|||{{|,,,,))))))))))..))))))))}...
Forensic Context
No forensic context available.