Basic Information

Symbol
hsa_IARS_0010200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-IARS_0087
Host gene
IARS
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:95018962-95036803 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:92256680-92274521 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-399.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -419.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.(.....).))))))((((..((.((.(((....))).)).))....(((((.(((((....(((((((.((.(((((((......).))))))))....(((((((((((...............(((.........)))((((((..((((..((((((((((..(.(((((((((....((((......))))......)).))))))).)..))))....))))))..)))).(((((......)))))((..(((((((..(((.....((((((((..(((..........)))((((........)))).......((((((.((((.....)))).)))))).))))))))..((((((((((((((((....((......(((((........))))))).))))))))..........(((((....)))))((........))..((..(((((.....)))))..))......(((((...)))))..))))))))(((((....)))))...(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..(((.....((((...)))))))))))...)))).))).))).))))))..........((((((((((((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((..((.((((...)))))).(((((((((.((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).)))))))..(((((((((((...(.(((.((((((((.((......)).))).)))))..))).)...))))))...((((((..((((((((.((......)).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))..................))))))))))).....))).)))).)).)))))).))).))))(((((...)))))....((.(((((......(((((.((.....)).))))).....)).))).))((((.((((((....)))))).))))))))))))).)))))).)))))))))))....((((....)))).))).)))))))..))...))))))...(((((......)))))...((((......)))))))....)))))))))))))))))))))))))...(((((((..............))))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((.(.....).))))))((((.,((.((.(((....))).)).}).,..(((((.(((((,...{((((((.((.(((((({......).))))))}}....(((((((((((..,............{{{..,......}}}((({{{..((((,,(({((((({{..{.(((({{{{{,,.,{|{|.,,..,}))),...,.)}.))))))),|,{||},....))))))..}}}}.(((((......)))))((..(((((((..(((.,,,,({{{{(((.((((..........)))||||........||||.{{....((((((.((((.....)))).)))))).}))}))))..{{{|||||((((((((....((......((((({......,))))))).))))))))..........,,.(((((((((((,(,.......,,..,,..,|||.})))))))))}.,,.,....(((((...)))))..}}})))))(((((....))))),..(((((((((((.((((((((((((((((((.((((......((((..((({....{{{{...}}}))))))))...)))).))).)))}})))))..........(((((((((,((((((...((((((.((.((((..(((...(((((..((((((.{({.((({...})))}}.(((((((({{((((((((.((((....)))).))(((((((((((......)))).))))))),.(((((((((((...{.(((.((((((((.,(,,....,),))).)))))..))).,...))))))...((((((..((((((((.{{......}).)))).)))))))))).))))))))))))))......))))))...,,...........})))))))))))).....)}).)))).)).)))))).))).)))|(((((...)))))}...((.{((((.,....(((((.((.....)).))))).....),}))).))((((.{(((((....)))))}.))))))))))))).)))))).)))))))))))....{(({....)))).))).)))))))..))....,,,,}..,(((((,,,..,|}}},,,.,|||}}}},,),,}}}}....)))))))))))))))))))))))))...(((((((..............))))))).....))))
Forensic Context

No forensic context available.