Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0040500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0053
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:107602307-107602861 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104840026-104840580 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-193.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -203.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 112.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.....(((.((((.........(((....)))(((((.((((.((((((((((..(((..(((...(((((.((((..((.......))..)))).))))))))..))).......((((.(((......(((((((((((.((........)))))).((((((((..........(((....))).........((((((((((.((((((((.(((((((((((((.....(((((((.......))).)))).....)))))))))).))))))))))).))))).))))).....(((((....((.....(((((((.......)))).))).....))..))))).))))))))...))))))).......))).)))).)))))))))).)))))))))((((((((((((.((...((((..(.(((............))).)..)))))))))))))))))).((((......(((.(.(((....))).).))).......))))..)))).)))......)))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{((((((..,,.(((.((((.........(((....)))(((((.((((.((((((((((..(((..(((...(((((.((((..((.......))..)))).))))))))..)))..,|{{.((((,{((((((....(((((((((....)),,}).)))).|.((((((((.{,.,,,,,.(((,,,,|||....,,...((((((((((.((((((((.(((((((((((((.....(((((((.......)))},))).....)))))))))).))))))))))).))))).)))))...,.{||||,}|.,{,|,..|||{||{.....,,||||.}}}....,)),))))}}.))))))))....))))))))))).....,}}...)))))))))).)))))))))(((,(((,,,,|}|,}}},,,,,,{.,,{........{{{{|||{|.{||}||||,||||||,,||,..,|}}..}}|||},}|,,},.}))}.)})),...})))),},..)))}.)))},....)))))).)}...
Forensic Context

No forensic context available.